计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 200|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 求助高温高压下三维交联网络结构和溶剂的反应路径模拟

[复制链接 Copy URL]

6

帖子

0

威望

20

eV
积分
26

Level 2 能力者

各位老师好!我打算用orca软件做图片上的反应模拟,反应条件是在密闭反应釜内280摄氏度3兆帕,20ml乙酸溶剂降解图片上的反应物,我想要算反应能垒,热力学能,我遇到的问题是:乙酸我不知道是作隐式溶剂化还是弄成显式模型作反应物,请问这种情况我要怎么处理?

b3422df1f0893c7d52075c57894f3ce8.png (121.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

如图所示的反应

如图所示的反应

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
127652

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2026-6-6 15:56:15 | 只看该作者 Only view this author
考虑酸催化就需要显式溶剂模型描述参与反应的乙酸分子,同时再带上隐式溶剂模型描述周围的溶剂环境
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6

帖子

0

威望

20

eV
积分
26

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-6-6 17:17:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-6-6 15:56
考虑酸催化就需要显式溶剂模型描述参与反应的乙酸分子,同时再带上隐式溶剂模型描述周围的溶剂环境

好的,谢谢老师!

6

帖子

0

威望

20

eV
积分
26

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-6-15 16:34:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-6-6 15:56
考虑酸催化就需要显式溶剂模型描述参与反应的乙酸分子,同时再带上隐式溶剂模型描述周围的溶剂环境

老师你好!我还有一个问题,降解反应中乙酸作为催化剂,在反应条件下需要考虑乙酸的状态吗?我查的资料,在反应条件下乙酸好像有一部分汽化了,汽化的话我还是可以按显式+隐式溶剂模型吗?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
127652

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2026-6-15 16:44:27 | 只看该作者 Only view this author
jbl2001 发表于 2026-6-15 16:34
老师你好!我还有一个问题,降解反应中乙酸作为催化剂,在反应条件下需要考虑乙酸的状态吗?我查的资料, ...

取决于反应的微环境是什么样的。反应的分子如果包裹在乙酸里,就需要用溶剂模型表现
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6

帖子

0

威望

20

eV
积分
26

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-6-15 16:46:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-6-15 16:44
取决于反应的微环境是什么样的。反应的分子如果包裹在乙酸里,就需要用溶剂模型表现

好的谢谢老师!我感觉反应还是在溶剂内发生的,我试一下溶剂化

6

帖子

0

威望

20

eV
积分
26

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-6-16 11:41:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-6-15 16:44
取决于反应的微环境是什么样的。反应的分子如果包裹在乙酸里,就需要用溶剂模型表现

老师你好!再次打扰你,我和我老师说了要用显式溶剂模型的问题,他觉得计算量太大,让我把乙酸当成反应物,不要用显式溶剂模型了。我想问一下老师,我们这样做可以吗?(我老师做仿真的,对我这个没有实际上做过)

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
127652

管理员

公社社长

8#
发表于 Post on 2026-6-16 12:48:47 | 只看该作者 Only view this author
jbl2001 发表于 2026-6-16 11:41
老师你好!再次打扰你,我和我老师说了要用显式溶剂模型的问题,他觉得计算量太大,让我把乙酸当成反应物 ...

语义不明
如果乙酸参与到反应,本来乙酸就是反应物,必须且只能对乙酸用显式溶剂模型,并且还需要同时带隐式溶剂模型表现周围的溶剂环境。如果乙酸不直接参与反应,就不叫反应物

计算化学领域只有“模拟”,没有“仿真”,看
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6

帖子

0

威望

20

eV
积分
26

Level 2 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-6-16 13:39:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-6-16 12:48
语义不明
如果乙酸参与到反应,本来乙酸就是反应物,必须且只能对乙酸用显式溶剂模型,并且还需要同时带 ...

好的谢谢老师的解答,我会注意写法和用词的

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-6-24 19:25 , Processed in 0.242481 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list