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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn资源与经验] 使用Multiwfn做自然跃迁轨道(NTO)分析

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-17 15:28:38 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2019-8-17 14:05
老师,您好,我想请问一下,计算NTO时,用TD-B3LYP/6-31G*的方法就可以了吗,还是说用TD-CAM-B3LYP/6-31G* ...

该用什么泛函做TDDFT看激发类型和体系,这里说了
乱谈激发态的计算方法
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发表于 Post on 2019-10-14 20:50:10 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好,我想请问一下,我在电脑桌面上建立了一个文档,然后把帖子中内容粘贴进去,并命名为allNTO.sh,然后Multiwfn程序也是安装在桌面上,然后老师发的帖子中说需要用“chmod 777 allNTO.sh给其加上可执行权限”之后再把该文档放到Multiwfn目录下,关于如何给桌面上的.sh文档加可执行权限这里不会操作,希望老师能辛苦告诉一下相关的步骤,谢谢老师了,辛苦啦

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-15 01:11:50 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2019-10-14 20:50
老师,您好,我想请问一下,我在电脑桌面上建立了一个文档,然后把帖子中内容粘贴进去,并命名为allNTO.sh ...

你用的是什么系统?.sh是Linux下的脚本,Windows下没法用
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-10-30 14:16:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xxzj 于 2020-10-30 14:18 编辑
sobereva 发表于 2017-8-18 22:59
更新:2017-Aug-17及之后更新的Multiwfn也完美支持ORCA做NTO分析,用其输出的.molden文件代替.fch文件,用O ...

老师,您好,我在文献中看到这张图片。然后是绘制的NTO轨道,但是这里的电子空穴距离以及库伦吸引力应该如何计算?谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-30 20:03:57 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2020-10-30 14:16
老师,您好,我在文献中看到这张图片。然后是绘制的NTO轨道,但是这里的电子空穴距离以及库伦吸引力应该 ...

仔细看了就明白了
使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征
http://sobereva.com/434http://bbs.keinsci.com/thread-10775-1-1.html

另外,单纯基于NTO轨道,Multiwfn也可以给出轨道质心距离衡量这个
使用Multiwfn考察轨道间重叠程度和质心距离
http://sobereva.com/371http://bbs.keinsci.com/thread-5596-1-1.html
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发表于 Post on 2020-10-31 08:05:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-10-30 20:03
仔细看了就明白了
使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征
http://sobereva.com/434(http:/ ...

谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-1 00:30:40 | 只看该作者 Only view this author
今日更新的Multiwfn支持了对任意轨道计算能量的功能,这也使得NTO轨道的能量可以被计算。计算NTO轨道能量的完整例子见最新版手册4.300.6节。
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发表于 Post on 2020-11-13 21:12:48 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xxzj 于 2020-11-13 21:15 编辑
sobereva 发表于 2018-3-2 19:47
鉴于有Multiwfn用户表示弄不明白开壳层体系的NTO分析,文中加入了个开壳层的例子

老师,想在卟啉中引入金属原子,研究了铜卟啉,钴卟啉,锌卟啉和镁卟啉四个分子,然后优化后发现,锌卟啉和镁卟啉只有一个HOMO与LUMO能级,但是钴卟啉和铜卟啉显示的是0 2,能级分为Alpha和Beta。我不太明白为什么会这样,是因为铜和钴都有一个单电子吗,那为什么锌和镁没有呢?如果优化的时候手动把“2”改成“1”可行吗?只想对比不同金属卟啉的变化,这样可以直接比较吗,辛苦老师了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-14 03:13:19 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2020-11-13 21:12
老师,想在卟啉中引入金属原子,研究了铜卟啉,钴卟啉,锌卟啉和镁卟啉四个分子,然后优化后发现,锌卟啉 ...

这是基本量化常识问题。非限制性开壳层计算必定有两套MO,需要分别说各自的HOMO。显然不可能把原先的0 2改成0 1,体系电子数是奇数时明显不可能是单重态。

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发表于 Post on 2020-11-14 13:10:35 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2020-11-13 21:12
老师,想在卟啉中引入金属原子,研究了铜卟啉,钴卟啉,锌卟啉和镁卟啉四个分子,然后优化后发现,锌卟啉 ...

数一下这几个金属离子的d电子数就知道原因了
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2021-3-18 16:16:55 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Trivers 于 2021-3-18 16:58 编辑

请问一下,为了得到NTO,用高斯计算时需要加入关键词IOp(9/40=4),那么如果是用ORCA计算的话,需要添加什么关键词呢?

发完帖子我自己就查到了,跟我有相同疑问的同学请参考本站sob老师的帖子:http://bbs.keinsci.com/thread-6546-1-1.html

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-1 03:18:34 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn现已经支持结合CP2K程序对周期性体系做NTO分析,见《使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和考察电子激发态》(http://sobereva.com/634)。
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发表于 Post on 2023-10-31 18:25:44 | 只看该作者 Only view this author
老师我想请教一下,利用使用Multiwfn查看所有激发态中的主要轨道跃迁贡献和使用Multiwfn做自然跃迁轨道(NTO)分析出来的轨道占比是不同的东西吗?为什么我利用这两种方式算同一个激发态的轨道占比时,发现同样的跃迁轨道占比不一样呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 08:34:55 | 只看该作者 Only view this author
yaya222 发表于 2023-10-31 18:25
老师我想请教一下,利用使用Multiwfn查看所有激发态中的主要轨道跃迁贡献和使用Multiwfn做自然跃迁轨道(NTO ...

完全不是一码事
你截图里体现的是各种MO之间跃迁产生的贡献,而用Multiwfn产生NTO后,同时给出的NTO本征值直接体现相应NTO pair跃迁的贡献,不可能恰好一样(除非某个电子激发100%是比如HOMO->LUMO跃迁,那么转化成的占据和非占据NTO也直接分别对应HOMO和LUMO)。
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