1. 前言
Apple 这几年一直在讲 iPad 的生产力，不过现实里它更多还是在刷剧，看论文，盖泡面之间反复横跳。
最近做计算时经常遇到一些很轻量的查看需求。人在外面，想快速看一眼超算上的任务有没有跑完，结构优化是否正常，有没有虚频以及orbital 或 ESP surface 大概长什么样。
为这种事情专门开电脑，连服务器，下载文件，再丢进可视化软件里看一眼，多少有些折腾，如果能直接在手机或者平板上进行想来会省不少事。
2. 功能介绍
Magpie 是一款面向 iPhone 和 iPad 的计算化学文件查看工具，它可以直接打开XYZ 文件以及解析 Gaussian 和 ORCA 的单点计算、几何优化、频率分析输出文件，并自动读取其中的结构、能量、优化轨迹和振动信息。
文件来源有两种，一种是通过 SSH 直连超算或工作站在目标目录里浏览和打开文件，另一种是从本地导入文件。
打开文件即可交互式查看分子模型以及测量几何结构，并支持播放输出文件中的优化轨迹以及频率振动模式动画。
Magpie 还支持 cube 文件的 surface 可视化，包括轨道、静电势着色的 van der Waals 表面和 IGMH。打开 cube 文件时需要选择数据类型；对于 ESP 和 interaction，需要先选择 surface cube，再选择 coloring cube。
SSH 连接支持密码、私钥以及 Password + Passcode。相关凭据会保存在 iOS Keychain 里。
除了查看文件，Magpie 也内置了一个轻量的 Geometry Editor。能够在移动端删改添加原子，调整几何，插入常用官能团。编辑完成后，结构可以导出为 Gaussian 或 ORCA 格式的输入文件以及 XYZ 文件。如果只是顺手调一下局部结构，可以直接在移动端上做完，随后借助Shortcut等支持SSH功能的app远程提交任务。
3. 基本操作
普通查看单指旋转双指平移捏合缩放，点击原子即设置其为旋转中心。
测量模式下，顺序点击所需原子即可测量距离键角和二面角。
几何编辑模式下，激活鼠标形状按钮选中原子后可以平移、旋转、删除、改元素或者添加片段，键长、键角和二面角可在选择模式按顺序选择原子后调整，默认第一个选中的原子为可移动原子。
更详细的功能介绍请参考第5节界面展示中的图片。
4. 当前状态
Magpie 目前兼容 iOS / iPadOS / MacOS 26，已经上传到 TestFlight，并开放有限测试名额，使用Safari中打开下面的链接即可安装。（受Apple条款限制，暂时无法对法国区用户开放测试）
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目前 Magpie 还处在 beta 阶段，界面和功能细节仍在持续调整。欢迎大家试用，也欢迎反馈 bug、使用体验和功能建议。
5. 界面展示
发表于 Post on 3 day ago
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