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楼主 Author: yanmu
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[新手求助] 计算方法和基组求组

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-5-31 15:13:14 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-5-31 09:04
#p opt freq m062x/6-31+g(d) temperature=323

另外即使freq计算时不加temperature命令,只要保留了ch ...

谢谢老师的耐心解答。那最后一个求溶剂化单点能时#p scrf=(solvent=acetonitrile,smd) m052x/6-31G(d)为什么变成了m052x/6-31G(d),我原先用的m062x/6-311++g(d,p),精度不够吗

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发表于 Post on 2017-5-31 15:25:13 | 只看该作者 Only view this author
yanmu 发表于 2017-5-31 15:13
谢谢老师的耐心解答。那最后一个求溶剂化单点能时#p scrf=(solvent=acetonitrile,smd) m052x/6-31G(d)为 ...

看此文
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327
SMD结合M052X/6-31G*时溶解自由能计算最准确
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-5-31 15:38:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-5-31 15:25
看此文
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327

谢谢老师,明白了好多

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发表于 Post on 2017-5-31 20:38:30 | 只看该作者 Only view this author
yanmu 发表于 2017-5-31 15:12
谢谢老师的耐心解答。那最后一个求溶剂化单点能时#p scrf=(solvent=acetonitrile,smd) m052x/6-31G(d)为 ...

谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-1 15:08:27 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-5-31 20:38
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327

谢谢,现在又懂了好多

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-8 21:34:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-5-31 15:25
看此文
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327

sob老师,我找过度态时出现 Error in internal coordinate system,然后我就加了opt=cartesian,能量一直下降,就是不收敛,需要加什么关键词

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发表于 Post on 2017-6-8 23:23:45 | 只看该作者 Only view this author
yanmu 发表于 2017-6-8 21:34
sob老师,我找过度态时出现 Error in internal coordinate system,然后我就加了opt=cartesian,能量一直 ...

量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-9 08:19:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-6-8 23:23
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-29 09:31:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-5-30 16:01
可以用m062x/6-311+g(d,p)//m062x/6-31+g(d)这个计算
结果不会定性错误,但算不上1L你说的精度很高, ...

老师,我目前用到的溶剂化模型smd结合m062x/6-311++g(d,p)或m052x/6-31g(d),能垒算的特别高,有点不符合实验现象,想问一下有没有更好的计算溶剂化单点能的基组能将能垒降低一些?

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发表于 Post on 2017-6-29 09:43:34 | 只看该作者 Only view this author
yanmu 发表于 2017-6-29 09:31
老师,我目前用到的溶剂化模型smd结合m062x/6-311++g(d,p)或m052x/6-31g(d),能垒算的特别高,有点不符 ...


溶解自由能就用m052x/6-31g*,不要考虑别的
单点可以尝试wB97XD、MN15、B3LYP。或者双杂化DSD-PBEP86-D3(BJ),此时基组起码用def2-TZVP
给氢加弥散无意义,见
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336
如果不是非得用弥散的体系,用def2-TZVP比6-311++G**强得多
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sobereva 发表于 2017-6-29 09:43
溶解自由能就用m052x/6-31g*,不要考虑别的
单点可以尝试wB97XD、MN15、B3LYP。或者双杂化DSD-PBEP86- ...

老师,我几何优化用的就是m062x/6-31g(d)了,所以计算单点能级别更好的基组是哪个呢?

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发表于 Post on 2017-6-29 21:23:01 | 只看该作者 Only view this author
yanmu 发表于 2017-6-29 11:32
老师,我几何优化用的就是m062x/6-31g(d)了,所以计算单点能级别更好的基组是哪个呢?

谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336
def2-TZVP
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-30 08:24:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-6-29 21:23
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336
def2-TZVP

#p scrf=(solvent=acetonitrile,smd)  m062x/def2-tzvp  是这样写吗

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发表于 Post on 2017-6-30 09:40:39 | 只看该作者 Only view this author
yanmu 发表于 2017-6-30 08:24
#p scrf=(solvent=acetonitrile,smd)  m062x/def2-tzvp  是这样写吗

RTFM!! http://sobereva.com/g09/m_basis_sets.htm

#p scrf=(solvent=acetonitrile,smd)  m062x/def2tzvp
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-30 10:21:19 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2017-6-30 09:40
RTFM!! http://sobereva.com/g09/m_basis_sets.htm

#p scrf=(solvent=acetonitrile,smd)  m062x/def ...

谢谢

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