计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7985|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Dalton] dalton计算时报错

[复制链接 Copy URL]

54

帖子

0

威望

649

eV
积分
703

Level 4 (黑子)

本帖最后由 stephenmessi 于 2017-7-18 15:30 编辑

各位老师好,之前在按照论坛里的dalton教程写了run.sh的脚本,放入文件夹中提交并运行,结果发生如下错误:
Error in mpirun -np 32 /home/a/DALTON-Source/build/dalton.x, exit code 100
dft_b3lyp_cart_H2O_intgrl.tar.gz has not been created and has thus not been copied to /home/a/DALTON-Source/build/test/dft_b3lyp_cart
----------------------------------------------------------
WARNING for ERROR  (Dalton program stopped with exit code 100)
/DALTON_scratch_a/dft_b3lyp_cart_H2O_intgrl_30455 is not deleted
  by this script so you may restart the calculation, if possible
/DALTON_scratch_a/dft_b3lyp_cart_H2O_intgrl_30455 may be deleted by your queueing system )
/DALTON_scratch_a/dft_b3lyp_cart_H2O_intgrl_30455 yourself !!!

Output from 'grep -n ERROR' :
214:DALTON FATAL ERROR: no file available with molecule input
216:  --- SEVERE ERROR, PROGRAM WILL BE ABORTED ---
221:@ Reason: ERROR: no molecule input available


运行命令的方式:将run.sh 放在test中对应的文件夹(里面已经有.mol和.dal文件)下,chmod +x run.sh 之后./run.sh
请问这样的情况是哪里出了问题,本人刚刚接触dalton,谢谢。



dft_b3lyp_cart.dal

83 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 10

DALTON test中自带文件

dft_b3lyp_cart_H2O_intgrl.out

15.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 7

run.sh

156 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 17

H2O_intgrl.mol

346 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 3

DALTON test中自带文件

908

帖子

37

威望

5435

eV
积分
7083

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2017-7-8 21:25:09 | 只看该作者 Only view this author
这种疑难杂症最好是上传你的run.sh 以及输出文件,以及你运行命令的方式。各种信息越多越详细越好

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 07:30 , Processed in 0.151528 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list