固相下优化出的S1，T1态能量低于S0态的问题

小范范1989 · 发表于 Post on 2017-11-5 17:54:14

ggdh 发表于 2017-11-5 15:52
我知道，你是说gromacs模拟的和单分子计算出来的eps差很大，不知道具体是差多少？

钟老师好，gromacs计算的图一，单分子计算的是图二。
我感觉gromacs计算的还行。不知道对不对。或者是我在计算单分子得到的时候，里面求体积或者polar的时候，有细节没有注意好。
谢谢钟老师指点。

ggdh · 发表于 Post on 2017-11-5 19:27:03

小范范1989 发表于 2017-11-5 17:54
钟老师好，gromacs计算的图一，单分子计算的是图二。
我感觉gromacs计算的还行。不知道对不对。或者是我 ...

gmx怎么算的才1点多，要知道真空也才1
是不是算错了。
倒是单分子算的值还比较靠谱

小范范1989 · 发表于 Post on 2017-11-6 07:26:02

本帖最后由小范范1989 于 2017-11-6 07:32 编辑

ggdh 发表于 2017-11-5 19:27
gmx怎么算的才1点多，要知道真空也才1
是不是算错了。
倒是单分子算的值还比较靠谱

钟老师好，gmx我就是通过当时sob老师的那个培训班。P117静态介电常数。那个公式求得的。（当时上课的时候，碰到过钟老师和孙老师，两位老师坐在我前面，我就在您后面，打过招呼。哈哈哈）

阳光总在风雨后 · 发表于 Post on 2017-11-6 10:24:20

ggdh 发表于 2017-11-5 11:00
我的意思是调控的时候不要加scrf，但是你的w显然是在调控的时候加了scrf后获得的。
因此你要在调控的时 ...

非常感谢老师的指点!

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