trjconv处理轨迹问题

guoy14iccas · 发表于 Post on 2017-11-17 21:12:53

为什么使用GROMACS的trjconv程序处理轨迹时。每个时刻都会在gro文件中显示时刻（图1）。而不是连续的（图2）只在最开始显示一个时刻。

guoy14iccas · 发表于 Post on 2017-11-17 21:40:36

我发现当只有一个分子时会显示所有时刻，多个分子时就不会一一显示出来这个时刻，想知道是不是程序默认这么干的？请教各位，谢谢。

wbn · 发表于 Post on 2017-11-18 07:54:08

图2中一帧还没完呢只是第一个分子写完了怎么会显示时刻

guoy14iccas · 发表于 Post on 2017-11-18 14:12:50

wbn 发表于 2017-11-18 07:54
图2中一帧还没完呢只是第一个分子写完了怎么会显示时刻

谢谢您的回复，是100个分子。10ns每10ps保存一帧，最终的gro文件仍旧只是显示初始时刻。中间的不会显示

wbn · 发表于 Post on 2017-11-19 11:43:39

guoy14iccas 发表于 2017-11-18 14:12
谢谢您的回复，是100个分子。10ns每10ps保存一帧，最终的gro文件仍旧只是显示初始时刻。中间的不会显示

图2是在一帧的中间，不是两帧的交界处

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[GROMACS] trjconv处理轨迹问题