Multiwfn如何不显示多余的弱力梯度面？

lao7

用两对DNA碱基和萘进行计算，通过Multiwfn呈现弱力（操作见Multiwfn 3.3.6说明书335页），但问题来了, 如附件图：
1）萘周围的分子斥力，如何看起来不那么稠密？因为研究的是周围的绿色的吸引力，这个红色斥力能否淡化或者看起来简单一些。做的如说明书335页一样的斥力一样小？
2）周围碱基想用棍表示，萘想用球表示，如何在一个体系中呈现原子及键的不同呈现方式？
谢谢！

sobereva

1 你的等值面数值不合适，取大了。上面氢键的区域的等值面周围出了一圈无意义的红色也是因为这个原因所致。
如果想屏蔽掉一部分红色或者所有红色区域，在计算完RDG+sign(lambda2)rho格点数据后，观看散点图，然后用
-3 Set function2 value where the value of function1 is out of a certain range
或
-2 Set function2 value where the value of function1 is within a certain range
把sign(lambda2)rho（函数1）为正的某些区域的RDG（函数2）设为100以屏蔽之。手册4.100.1节靠后部分也有示例。

2 假设萘的原子编号是1-18，在graphic-representation里把原先的CPK显示方式的selected atom里写成all not (serial 1 to 18)，然后点create rep新增显示方式，selected atom输入serial 1 to 18，然后再把drawing method改成你希望的。


另外，建议你把display-depth cueing关掉，否则图像雾蒙蒙的。

lao7

谢谢，过年回家了，没有看到回复。