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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn资源与经验] 绘制有填色效果的用于弱相互作用分析的RDG散点图的方法

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发表于 Post on 2022-6-29 11:38:35 | 只看该作者 Only view this author
请问为何我下载了ghostscript,还是无法用irfanview打开RDGmap.ps

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-30 00:48:43 | 只看该作者 Only view this author
Manyu 发表于 2022-6-29 11:38
请问为何我下载了ghostscript,还是无法用irfanview打开RDGmap.ps

ghostscript没恰当安装,或者没被irfanview识别,或者你的ps文件本身就有毛病
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-7-18 10:02:36 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,这是我算IRI散点图的输出文件(图片1)

根据老师您放B站的教程视频,我也是用UE删了前面三列(图片2)

但是画出的图是这样子的(图片3),横坐标是从-0.05到0.05,而Multiwfn直接绘图是这样的(图4),横坐标从-0.4到0.1.

然后我用记事本改了RDGscatter.gnu中x轴范围图(5),画出的散点图依旧没有任何变化。

请问这种情况该如何解决呢?

202207180953507288..png (71.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 78)

202207180953507288..png

202207180955436862..png (156.16 KB, 下载次数 Times of downloads: 84)

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202207180956082155..png (175.47 KB, 下载次数 Times of downloads: 86)

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202207180958478416..png (49.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 77)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-18 11:44:19 | 只看该作者 Only view this author
20mllu1 发表于 2022-7-18 10:02
老师您好,这是我算IRI散点图的输出文件(图片1)

根据老师您放B站的教程视频,我也是用UE删了前面三列 ...

目前版本Multiwfn根本就不需要自己改txt文件,仔细看1L

最新版Multiwfn的examples\scripts目录里直接给了IRIscatter.gnu,直接用就完了
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发表于 Post on 2022-7-23 09:55:45 | 只看该作者 Only view this author
Manyu 发表于 2022-6-29 11:38
请问为何我下载了ghostscript,还是无法用irfanview打开RDGmap.ps

您好,我也出现了这个问题,请问您解决了吗

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发表于 Post on 2022-7-23 11:34:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-30 00:48
ghostscript没恰当安装,或者没被irfanview识别,或者你的ps文件本身就有毛病

老师您好,我完全跟着您的方法用gnuplot生成的.ps文件,ghostscipt和irfanview装好之后里面自带的例子可以打开,但我自己生成的ps文件就打不开,我也觉得是文件的问题,该怎么解决呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-23 14:33:51 | 只看该作者 Only view this author
好运来 发表于 2022-7-23 11:34
老师您好,我完全跟着您的方法用gnuplot生成的.ps文件,ghostscipt和irfanview装好之后里面自带的例子可 ...

没具体信息没法说
至少得提供你的output.txt,能让别人重复你的情况
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发表于 Post on 2024-7-19 20:46:52 | 只看该作者 Only view this author
卢老师您好,请教您2个问题,(1)用DFT-B3LYP/6-311G**优化邻硝基苯胺的结构,并且基于这个优化结构算了一系列性质。但是当研究邻硝基苯胺中分子内氢键这种弱相互作用时,看您的博文说应该考虑色散。像这种情况还能不能用DFT-B3LYP/6-311G**优化的这个结构啊?还是必须考虑色散,比如在B3LYP-D3(BJ)/6-311G**水平上重新优化,再基于这个重新优化的结构研究弱相互作用?
(2)仍然是用DFT-B3LYP/6-311G**优化邻硝基苯胺的结构,但是预测某些性质时,用到的公式是基于DFT-B3PW91/6-31G*得到的经验公式。像这种情况是不是也需要把邻硝基苯胺在DFT-B3PW91/6-31G*下重新优化,然后再用这个公式进行计算?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-23 03:36:16 | 只看该作者 Only view this author
jingetiema6112 发表于 2024-7-19 20:46
卢老师您好,请教您2个问题,(1)用DFT-B3LYP/6-311G**优化邻硝基苯胺的结构,并且基于这个优化结构算了一 ...

1 拿不准就一律带着色散校正,下文明确说了
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413

2 严格来说是
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发表于 Post on 2024-7-23 15:37:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-23 03:36
1 拿不准就一律带着色散校正,下文明确说了
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobere ...

好的,感谢卢老师指导

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