如何体现水的酸碱性

wx91aaa · 发表于 Post on 2018-3-1 21:25:01

我想通过Gromacs研究水的酸碱性对醇类在水中的溶解度。参照培训班讲义里的添加Na和Cl离子的方法，没有在top文件里找到H离子和氢氧根的itp的文件。别的文献里体现体系酸碱性都是改变带电基团的性质。但是我的体系中除了水和醇没有其他基团了，该如何改变体系的酸碱性呢？谢谢各位大神了！！！

Graphite · 发表于 Post on 2018-3-3 11:37:45

可以根据PH值适当改变水的质子化态，例如100个水分子中有10个是H3O+
如果自己不是很确定，可以用openbabel生成。

02130213aaa · 发表于 Post on 2018-3-4 21:37:25

Graphite 发表于 2018-3-3 11:37
可以根据PH值适当改变水的质子化态，例如100个水分子中有10个是H3O+
如果自己不是很确定，可以用openbabel ...

谢谢您！

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[GROMACS] 如何体现水的酸碱性