计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7162|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析交流] 给能量分解和SAPT分析挑点毛病

[复制链接 Copy URL]

729

帖子

21

威望

5233

eV
积分
6382

Level 6 (一方通行)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 beefly 于 2018-3-16 15:43 编辑

虽然能量分解(本文把EDASAPT这类方法统称为能量分解,不做区分)常用来研究相互作用类型,但也不可盲目相信。这里举些反例。
1,分子片带电荷
在能量分解计算中,分子片的电荷只能是整数。若分子片AB带有一定电荷且偏离整数,能量分解的结果往往不可靠。例如[A+0.3][B-0.3],无论是按照AB还是按照A+B-去分解,结果可能都有问题。典型例子有HArF体系(根据计算方法的不同,Ar的原子电荷为+0.5+0.7),不同分解方案得到的结论相差十万八千里:
https://link.springer.com/chapter/10.1007/b11312


还有XeAuF分子(Xe原子带+0.2+0.3个正电荷)。波函分析显示Xe-Au存在共价键(JACS, 2004, 126,17000),并且能找到成键轨道从而估算经验键级是1。而能量分解的结果却显示,Xe-Au键是纯色散导致的弱相互作用。如果用不含色散作用的HF方法优化XeAuF的结构,得到的Xe-Au键长在2.80 A(高精度理论结果2.55 A),仍然在化学键的范围内。说明色散作用对Xe-Au键并不占主要地位,能量分解高估了色散作用的贡献。

2X-H…π相互作用

早期观点一般认为,X-H…π相互作用属于弱氢键,这也被大多数理论和实验的各种分析方法所证实。但是能量分解的结果却发现,只有X=卤素、氧时才是氢键,而N-H…πC-H…π全是色散引起的范德华键。已经发表了大量用能量分解分析此类相互作用的文章(可以用google scholar搜索"electrostatic""dispersion" "benzene" "methane")。虽然大部分实验的人不同意这个观点,而且在理论界也有微弱的质疑声音,但目前几乎已经成了理论界的主流观点。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +8 收起 理由
Reason
sobereva + 8 欢迎讨论

查看全部评分 View all ratings

176

帖子

0

威望

1452

eV
积分
1628

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2019-1-15 11:05:13 | 只看该作者 Only view this author
这样说的话,有时候做能量分解也是不靠谱的。
判断弱相互作用是静电还是色散作用主导,可以用不带有色散矫正的泛函进行优化,并且加上色散矫正再优化,从两者的键长不同进行对比。如果影响颇大,键长的变化应该是很大吧?
比如我用B3LYP泛函优化结构得到了...O-H键长,用M062X-D3优化得到了...O-H的键长之间对比,就可能定性说明色散作用的影响吗?
还是只能用B3LYP和B3LYP-D3去优化对比呢?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120137

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2019-1-15 11:55:15 | 只看该作者 Only view this author
杨小狗 发表于 2019-1-15 11:05
这样说的话,有时候做能量分解也是不靠谱的。
判断弱相互作用是静电还是色散作用主导,可以用不带有色散矫 ...

显然得用同一种,而且是完全没法描述色散作用的泛函加不加零阻尼D3来对比
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

176

帖子

0

威望

1452

eV
积分
1628

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2019-1-15 17:02:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-1-15 11:55
显然得用同一种,而且是完全没法描述色散作用的泛函加不加零阻尼D3来对比

这样啊 这样的话还需要懂得更多的关于色散作用的知识

1043

帖子

0

威望

4174

eV
积分
5217

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2019-1-15 18:10:08 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
EDA和SAPT还有个致命伤是无法处理较强共价作用的一对分子片段, 比如处理乙烷两个甲基间的作用,因为优化片段波函数要进行开壳层计算,而复合分子是闭壳层的。我看Frenking他们曾EDA过二茂铁等夹心化合物中金属与配体间的作用,我持保留态度。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 18:36 , Processed in 0.269613 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list