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标题: 单机安装vasp5.4.4，系统SUSE 12 SP3，编译器Intel_Parallel_Studio_XE_2019_Linux [打印本页]

作者
Author: lindlar 时间: 2018-11-29 18:01
标题: 单机安装vasp5.4.4，系统SUSE 12 SP3，编译器Intel_Parallel_Studio_XE_2019_Linux
本帖最后由 lindlar 于 2022-6-15 10:35 编辑

成功编译vasp5.4.4，不是一件容易事，网上很多都需要安装openmpi、fftw等，其实直接采用intel 编译器、intel mpi和mkl等，可以简化不少步骤，而且效率更高。本人系统SUSE 12 SP3，安装Intel_Parallel_Studio_XE_2019_Linux，已经成功编译了vasp5.4.4，步骤如下：

1、intel编译器、intel mpi和intel mkl数据库配置如下：
   #intel
   source /opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/bin/compilervars.sh intel64
   source /opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mkl/bin/mklvars.sh intel64
   export MKL_HOME=/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mkl
   export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mkl/lib/intel64
   source /opt/intel/impi/2019.0.117/intel64/bin/mpivars.sh

2、编译Intel fftw3xf，使目录下含有 $(MKLROOT)/interfaces/fftw3xf/libfftw3xf_intel.a
   cd ~/.../interfaces/fftw3xf
   make libintel64 compiler=intel64
3、打补丁patch.5.4.4.16052018.gz
   gunzip patch.5.4.4.16052018.gz
   cd vasp.5.4.4
   patch -p0 < ../patch.5.4.4.16052018

4、用arch/makefile.include.linux_intel做为模板，修改makefile.include，仅添加MKLROOT位置即可
   OFLAG    = -O2 -xhost (参考版主的意见)
   MKLROOT =/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mkl

5、执行编译
   make all
   编译完成后将在build目录下生成对应的版本的可执行程序：vasp_gam、vasp_ncl、vasp_std

6、直接将vasp_std拷入/bin下，或者在~/.bashrc下添加路径即可计算

注意：
1、安装intel 2019，再安装openmpi-1.6.5/2.02/3.13/4.0.0，再编译vasp都会出错，都是BLACS    = -lmkl_blacs_openmpi_lp64的问题
2、安装intel 2015，再安装openmpi-1.6.5/2.02/3.13/4.0.0，再编译vasp也会出错，也是上面的问题

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-29 18:21
如果编译出的程序只在本机运行，可以在OFLAG里用-xhost，这样就会用本机CPU目前能支持的最高档次的SIMD指令集，省得手动指定指令集了（考虑到有些人可能不知道当前机子的CPU最多支持到什么）
若用-ax，ifort会考虑到对非Intel CPU的兼容性，在编译出的程序里增加兼容其它CPU的执行路径，会导致文件体积增大。Intel的CPU如果直接明确指定指令集建议用-x

作者
Author: lindlar 时间: 2018-11-29 22:13
谢谢版主指导，哪几个参数是参考别人的

作者
Author: wgwdhychg 时间: 2019-11-1 21:15
您好，按照您的方法，编译出了如下错误
warning: libfabric.so.1, needed by /opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mpi/intel64/lib/release/libmpi.so, not found (try using -rpath or -rpath-link)
/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mpi/intel64/lib/release/libmpi.so: undefined reference to `fi_tostr@FABRIC_1.0'
/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mpi/intel64/lib/release/libmpi.so: undefined reference to `fi_dupinfo@FABRIC_1.1'
/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mpi/intel64/lib/release/libmpi.so: undefined reference to `fi_strerror@FABRIC_1.0'
/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mpi/intel64/lib/release/libmpi.so: undefined reference to `fi_getinfo@FABRIC_1.1'
/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mpi/intel64/lib/release/libmpi.so: undefined reference to `fi_freeinfo@FABRIC_1.1'
/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mpi/intel64/lib/release/libmpi.so: undefined reference to `fi_fabric@FABRIC_1.1'
makefile:145: recipe for target 'vasp' failed
make[2]: *** [vasp] Error 1
make[2]: Leaving directory '/home/simu/Documents/vasp.5.4.4/build/std'
cp: cannot stat 'vasp': No such file or directory
makefile:142: recipe for target 'all' failed
make[1]: *** [all] Error 1
make[1]: Leaving directory '/home/simu/Documents/vasp.5.4.4/build/std'
makefile:10: recipe for target 'std' failed
make: *** [std] Error 2
求指导，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-2 08:49

wgwdhychg 发表于 2019-11-1 21:15
您好，按照您的方法，编译出了如下错误
warning: libfabric.so.1, needed by /opt/intel/compilers_and_l ...

严格照着这个视频操作
VASP的最简单的安装方法（含视频演示）
http://sobereva.com/455（http://bbs.keinsci.com/thread-11812-1-1.html）

作者
Author: 万里云 时间: 2019-11-2 10:58
难得见到一个用suse系统的。以前见到的都是centos/debian/ubuntu。

作者
Author: lindlar 时间: 2019-11-7 21:14

wgwdhychg 发表于 2019-11-1 21:15
您好，按照您的方法，编译出了如下错误
warning: libfabric.so.1, needed by /opt/intel/compilers_and_l ...

你的系统是什么？把编译文件发过来看看

作者
Author: lindlar 时间: 2019-11-7 21:17

万里云发表于 2019-11-2 10:58
难得见到一个用suse系统的。以前见到的都是centos/debian/ubuntu。

之前一直用的是SUSE，后来觉得习惯了，就没有换系统

作者
Author: abin 时间: 2019-11-8 12:38
也可以看看这个。
https://www.bilibili.com/video/a ... 4439882086510308069

全套视频，编译vasp 544

作者
Author: gog 时间: 2020-12-11 17:03

万里云发表于 2019-11-2 10:58
难得见到一个用suse系统的。以前见到的都是centos/debian/ubuntu。

换用redhat ，目前版本7.9

作者
Author: comchem 时间: 2023-10-26 10:24
请问vasp的补丁文件哪里有下载？

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