计算化学公社

标题: orca后台运行失败 [打印本页]

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Author: 倪宇晴 时间: 2019-5-8 20:59
标题: orca后台运行失败
ORCA4.1用nohup  orca CD.inp >& CD.out & 输出文件报错，报错信息为：/usr/lib64/python2.7/site-packages/orca/orca.py:52: PyGIWarning: Gtk was imported without specifying a version first. Use gi.require_version('Gtk', '3.0') before import to ensure that the right version gets loaded.
  from gi.repository import Gtk
/usr/lib64/python2.7/site-packages/orca/mouse_review.py:31: PyGIWarning: Wnck was imported without specifying a version first. Use gi.require_version('Wnck', '3.0') before import to ensure that the right version gets loaded.
  from gi.repository import Wnck
The following are not valid: CD.inp
Another Orca process is already running for this session.
Run "orca --replace" to replace that process with a new one.

请问各位老师，出现这种问题应如何解决。

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Author: ChrisZheng 时间: 2019-5-8 21:52
感觉你运行的不是量子化学计算软件orca 你可以用whereis orca看看运行的是什么

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Author: 倪宇晴 时间: 2019-5-8 22:19

ChrisZheng 发表于 2019-5-8 21:52
感觉你运行的不是量子化学计算软件orca 你可以用whereis orca看看运行的是什么

谢谢，的确是这个问题。奇怪的是只能写ORCA的绝对路径，在环境变量里的alias好像不起作用。
我把ORCA程序alias成ORCA4，不用nohup的时候可以正常运行，用nohup就会报错nohup: failed to run command ‘ORCA4’: No such file or directory

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Author: 让你变成回忆 时间: 2019-5-9 08:17
http://sobereva.com/451 《量子化学程序ORCA的安装方法》
有些系统如CentOS自带了名为orca的带有图形界面的屏幕阅读器程序，直接输入orca命令启动的是那个程序，和本文的orca毫无联系。应当用rpm -e orca命令将自带的那个orca卸载掉。
选自上述博文。

作者
Author: CocuLiu 时间: 2022-5-28 12:04
您好，我今天遇到了和您一样的问题，请问您最后是如何解决的呢？怎样卸载掉centos自带的orca呢？因为直接运行博文中的卸载命令好像不行。谢谢！！！

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Author: abin 时间: 2022-5-28 12:41

CocuLiu 发表于 2022-5-28 12:04
您好，我今天遇到了和您一样的问题，请问您最后是如何解决的呢？怎样卸载掉centos自带的orca呢？因为直接运 ...

搜索我的贴文，
下载即用，无需任何操作。

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Author: wzkchem5 时间: 2022-5-28 15:03

CocuLiu 发表于 2022-5-28 05:04
您好，我今天遇到了和您一样的问题，请问您最后是如何解决的呢？怎样卸载掉centos自带的orca呢？因为直接运 ...

不用卸载，只要你调用orca的时候总是设置PATH变量，并且总是把你的orca的路径放在PATH所有路径之前，就行了

作者
Author: CocuLiu 时间: 2022-5-29 18:50

wzkchem5 发表于 2022-5-28 15:03
不用卸载，只要你调用orca的时候总是设置PATH变量，并且总是把你的orca的路径放在PATH所有路径之前，就行 ...

谢谢您的解答，但是我运行时输入orca的绝对路径，提示error while loading shared libraries: liborca_tools_4_0_1_2.so: cannot open shared object file: No such file or directory

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-5-29 19:32

CocuLiu 发表于 2022-5-29 11:50
谢谢您的解答，但是我运行时输入orca的绝对路径，提示error while loading shared libraries: liborca_to ...

哦，你用的是shared library版，那样的话还需要设置LD_LIBRARY_PATH变量。同样需要把orca的路径放在LD_LIBRARY_PATH已有的所有路径之前

作者
Author: abin 时间: 2022-5-29 20:08
嗯，我说的是这个。
http://bbs.keinsci.com/thread-26418-1-1.html

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