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标题: kisthelp计算反应速率常数的问题 [打印本页]

作者
Author: jing-quan63 时间: 2019-5-27 14:34
标题: kisthelp计算反应速率常数的问题
本帖最后由 jing-quan63 于 2019-5-27 15:52 编辑

大家好：
  最近参考帖子采用kisthelp计算反应速率常数，关于其中反应对称数部分存在以下疑惑： 1:帖子里输入反应坐标时，sober老师是采用的默认步长吗？比如我现在步长是1，那是不是每个点的间隔就是0.01？
  2：对于稍微复杂些的体系，怎么判断反应物及过渡态的手性异构数目，尤其是过渡态，本人非化学相关专业，只会判断比较明显的体系，有无文章参考。
  3：尽管阅读了帖子里关于旋转对称数的那篇文章，但在实际应用时，直接根据高斯输出文件的数据来判断，是否可靠？
谢谢大家！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-27 17:20
1 这个问题和反应对称数毫无直接关系。kisthelp程序里只有做CVT计算的时候才牵扯你说的
间隔大小无所谓。只是为了区分在反应坐标上谁前谁后

2 帖子里已经说了，看Theor Chem Account (2007) 118:813–826
要么就用我这个表格算，只要Gaussian做振动分析的时候判断对了点群，自己根本不需要考虑转动对称数，比用kisthelp省事得多
基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格
http://sobereva.com/310（http://bbs.keinsci.com/thread-2350-1-1.html）

3 你没说清楚你所谓的判断是怎么判断

作者
Author: jing-quan63 时间: 2019-5-27 17:53
本帖最后由 jing-quan63 于 2019-5-27 17:56 编辑

sobereva 发表于 2019-5-27 17:20
1 这个问题和反应对称数毫无直接关系。kisthelp程序里只有做CVT计算的时候才牵扯你说的
间隔大小无所谓。 ...

谢谢老师，我说的判断意思就是默认为高斯识别分子点群正确，直接采用输出文件中的转动对称数。另外您这个表格我之前就下载过，但是还是想做一下扁粉速率常数计算，比较担心反应路径简并度计算出错，尤其是手性异构数

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-27 19:07

jing-quan63 发表于 2019-5-27 17:53
谢谢老师，我说的判断意思就是默认为高斯识别分子点群正确，直接采用输出文件中的转动对称数。另外您这个 ...

用我的表格照样可以做CVT
自行把IRC附近几个点的自由能算出来，拿最大那个点当做计算自由能垒的结构照常用我的excel表格就完了，比用kisthelp还省事

作者
Author: liuyjhx 时间: 2019-7-24 23:47

sobereva 发表于 2019-5-27 17:20
1 这个问题和反应对称数毫无直接关系。kisthelp程序里只有做CVT计算的时候才牵扯你说的
间隔大小无所谓。 ...

老师请问我想估算不同温度下两个竞争反应的生成比例，我现在都是在298下模拟的，所以现在计算出来在这个温度的选择性，我现在想计算273k下两个竞争反应的生成比例，怎么得到呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-7-25 21:15

liuyjhx 发表于 2019-7-24 23:47
老师请问我想估算不同温度下两个竞争反应的生成比例，我现在都是在298下模拟的，所以现在计算出来在这个 ...

计算273K下自由能热校正量，加到单点能上，得到273K的自由能，然后再代入公式计算比例

作者
Author: liuyjhx 时间: 2019-7-25 21:39

sobereva 发表于 2019-7-25 21:15
计算273K下自由能热校正量，加到单点能上，得到273K的自由能，然后再代入公式计算比例

老师请问273K下的热校正量用TST算吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-7-25 21:53

liuyjhx 发表于 2019-7-25 21:39
老师请问273K下的热校正量用TST算吗？

TST是算k的，怎么可能算热力学校正量

作者
Author: liuyjhx 时间: 2019-7-25 22:16
本帖最后由 liuyjhx 于 2019-7-26 08:17 编辑

sobereva 发表于 2019-7-25 21:53
TST是算k的，怎么可能算热力学校正量

明白谢谢

作者
Author: Luffy-D-M 时间: 2019-12-12 20:23

sobereva 发表于 2019-5-27 17:20
1 这个问题和反应对称数毫无直接关系。kisthelp程序里只有做CVT计算的时候才牵扯你说的
间隔大小无所谓。 ...

老师，用您的哪个表格算隧道校正系数频率是带入的负值吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-15 10:35

Luffy-D-M 发表于 2019-12-12 20:23
老师，用您的哪个表格算隧道校正系数频率是带入的负值吗？

那叫虚频
诸如2850i，就代入2850

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