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标题: 柔性扫描中Gaussian判定两个分子中的三个原子键角180°导致报错怎么办 [打印本页]

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2019-9-10 09:11
标题: 柔性扫描中Gaussian判定两个分子中的三个原子键角180°导致报错怎么办
各位老师好，最近在计算一个分子和溶剂分子（甲醇）的氢键，做一个柔性扫描。做到一半，高斯报错，甲醇中的两个原子和目标分子中的一个原子键角为180°，导致一系列二面角也出现了错误，请问有没有什么方法可以把两个分子独立开，不去计算分属于两个分子的原子之间的键角、二面角。
以下是报错信息：
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Using GEDIIS/GDIIS optimizer.
Bend failed for angle 20 - 19 - 30
Tors failed for dihedral 30 - 19 - 20 - 43
Tors failed for dihedral 30 - 19 - 20 - 44
Tors failed for dihedral 30 - 19 - 20 - 45
Tors failed for dihedral 20 - 19 - 30 - 15
FormBX had a problem.

附图为GV部分图

作者
Author: wull 时间: 2019-9-10 10:12
原子位置稍微移动一下继续算

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2019-9-10 12:55

wull 发表于 2019-9-10 10:12
原子位置稍微移动一下继续算

好的谢谢，我先去试试看

作者
Author: sobereva 时间: 2019-9-10 13:37
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

由于柔性扫描过程本质上相当于一大批限制性优化，而几何优化过程中Gaussian要求不能中途出现三个原子排成直线的情况，因此柔性扫描任务中途有可能因为出现三个原子排成直线而报错。这也没有什么简单而且一定奏效的做法可以解决。碰上这种情况可以考虑调整扫描设定试图避开出现这种现象的可能；或者对柔性扫描中失败的点手动做限制性优化，然后遇到三个原子排成直线时，取最后的结构沿用之前的设定进一步优化（由于此时初始结构里就已经有三个原子排成直线，Gaussian会做一些恰当处理使得优化往往可以继续进行）。

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2019-9-10 16:43

sobereva 发表于 2019-9-10 13:37
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html ...

谢谢sob老师！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)