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标题: gaussion计算反应自由能结果是正值，与文献不一样 [打印本页]

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Author: ch199412 时间: 2019-10-21 11:00
标题: gaussion计算反应自由能结果是正值，与文献不一样
本帖最后由 ch199412 于 2019-10-23 14:55 编辑

请问计算反应的吉布斯自由能，就是将产物的 Sum of electronic and thermal Free Energies之和减去反应物的 Sum of electronic and thermal Free Energies之和对吧？这些通过opt+freq计算可得，两个反应物结构和反应如图：

但最后产物减去生成物的自由能是正值，与文献值不符合

作者
Author: ch199412 时间: 2019-10-21 20:10
标题: gaussion反应自由能的计算
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sob老师，上个帖子没发好，我重新整理下。我采用文献中的方法想计算反应吉布斯自由（DFT/B3LYP/6-311G）来比较两个反应哪个更容易
问题1：我按照opt+freq计算方法算出，各产物与反应物的Sum of electronic and thermal Free Energies相减得出反应自由能，但是正值，与文献不符
问题2：迈克尔加成反应脱去了两个氢离子，那两个氢离子生成什么，应该怎么算自由能？
希望sob老师和大佬们能帮我看看，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2019-10-21 21:47
发帖时注意排版，看着很乱。记住Gaussian怎么拼，以后别再拼错

通常G不这样算，怎么算仔细看
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327（http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html）

文中的计算级别非常差，作者连极化函数都不知道加，非常业余。该用什么基组仔细看
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336（http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html）

这年头算有机反应能量还用B3LYP简直是自杀，看
坚持使用B3LYP算有机体系的人的下场
http://bbs.keinsci.com/thread-12773-1-1.html

这篇文章能发出来很侥幸

作者
Author: sobereva 时间: 2019-10-21 21:52

ch199412 发表于 2019-10-21 20:10
sob老师，上个帖子没发好，我重新整理下。我采用文献中的方法想计算反应吉布斯自由（DFT/B3LYP/6-311G） ...

帖子没发好就重新编辑原帖，不要发重新发新的帖子，否则会扰乱论坛秩序

作者
Author: ch199412 时间: 2019-10-23 09:55
本帖最后由 ch199412 于 2019-10-23 15:15 编辑

sobereva 发表于 2019-10-21 21:47
发帖时注意排版，看着很乱。记住Gaussian怎么拼，以后别再拼错

通常G不这样算，怎么算仔细看

谢谢sob老师，我好好学习下，排版我也重新修改了下

作者
Author: ch199412 时间: 2019-10-23 22:03

sobereva 发表于 2019-10-21 21:47
发帖时注意排版，看着很乱。记住Gaussian怎么拼，以后别再拼错

通常G不这样算，怎么算仔细看

sob老师，我按照你发的内容看了，学到了很多，但是我还是想问下我那个迈尔克加成反应脱去的两个氢离子自由能怎么算？也是按照溶剂化自由能算吗？是不是算单个H+（画一个氢原子设置charge：1 spin：singlet）的能量乘以2？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-10-24 07:07

ch199412 发表于 2019-10-23 22:03
sob老师，我按照你发的内容看了，学到了很多，但是我还是想问下我那个迈尔克加成反应脱去的两个氢离子自 ...

质子溶解自由能通过现有溶剂模型无法算准，应当直接用最佳的推测值（J. Phys. Chem. B, 110, 16066 (2006)）
标况下H+气相自由能精确值为-6.28 kcal/mol，无需计算
二者相加即是溶剂下的H+的自由能

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