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标题: 关于ambertools并行的问题 [打印本页]

作者
Author: 18217265596 时间: 2019-10-22 16:58
标题: 关于ambertools并行的问题
我是18核的机器，最近意识到我的每个sander跑起来都是一核有难众核围观
请问没有amber的conda安装的ambertools是否可以并行运行
还是并行需要下源码编译（根本下不下来太慢）
还是需要购买amber才可以
谢谢各位老师

作者
Author: puzhongji 时间: 2019-10-22 22:43
可以并行，具体请看http://bbs.keinsci.com/thread-311-1-1.html

作者
Author: sobereva 时间: 2019-10-23 01:40
对于目前最新的ambertools19，通过conda安装的只支持串行。并行必须自己编译
免费的Ambertools里的sander（自己编译的方式），以及收费的PMEMD都可以并行，PMEMD的好处是支持GPU加速

作者
Author: 18217265596 时间: 2019-10-23 08:16

sobereva 发表于 2019-10-23 01:40
对于目前最新的ambertools19，通过conda安装的只支持串行。并行必须自己编译
免费的Ambertools里的sander ...

好的，谢谢社长。

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