计算化学公社

标题: 如何构建氢自由基进攻位置的问题 [打印本页]

作者
Author: 朱陈 时间: 2019-12-7 17:25
标题: 如何构建氢自由基进攻位置的问题
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各位老师，我在找氢自由基进攻4号碳的过渡态，但是氢的位置一直摆放的不对，能量变化也一直上升，麻烦老师您可以看一下我的输入文件
能指点我一下。万分感谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-7 19:28
过渡态初猜明显不合适，既然要进攻4号原子，怎么也得把周围的键往后掰
我建议你先把产物结构优化出来，这样便于你判断过渡态该怎么摆（应介于反应物和产物之间）

作者
Author: 朱陈 时间: 2019-12-7 19:45

sobereva 发表于 2019-12-7 19:28
过渡态初猜明显不合适，既然要进攻4号原子，怎么也得把周围的键往后掰
我建议你先把产物结构优化出来，这 ...

好的，老师。谢谢老师的回复

作者
Author: 朱陈 时间: 2019-12-8 22:13

朱陈发表于 2019-12-7 19:45
好的，老师。谢谢老师的回复

非常抱歉打扰您了，我调整了结构找了两天的过渡态，其震动方向不是氢向碳4运动，我上传了用B3LYP/6-311G**优化后的
反应物和生成物以及我初猜的结构，麻烦老师您看一下，我过渡态的结构需要怎么调整。再次感谢老师您了。

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-15 11:36

朱陈发表于 2019-12-8 22:13
非常抱歉打扰您了，我调整了结构找了两天的过渡态，其震动方向不是氢向碳4运动，我上传了用B3LYP/6-311G* ...

把product里C4-H26做个拉长的柔性扫描，用极大点位置作为过渡态初猜
注意要以对称破缺方式计算，否则没法正确表现解离曲线，参考下文里相关例子
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

作者
Author: granvia 时间: 2019-12-15 12:28
您确定氢自由基进攻存在能垒？

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