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标题: 求助DA共轭体系二面角势能面扫描 [打印本页]

作者
Author: Huaiman 时间: 2020-1-7 13:26
标题: 求助DA共轭体系二面角势能面扫描
在算DA共轭体系的势能面能量时，设定二面角变化，用scan计算所得曲线的小角度区域有问题，原因是D环在二面角减小时发生扭曲使体系能量降低。为了保持环的形状，首先冻结了D环原子做SCAN，但A环发生扭曲。因此，最后采用计算不同二面角的单点能的方法拼势能面，将D, A两环分别冻结，计算不同二面角的能量。在计算过程中出现Only 1 rigid fragment with regular optimizer的错误。想请问各位大佬如何解决这个问题，或者有其他的方法计算势能面？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-1-7 18:22
描述太抽象，直接贴个图，说明扫的是哪个角

刚性扫描二面角的做法在此文里介绍了，看“4 使用gentor结合Gaussian做二面角的刚性扫描”部分，不需要做冻结设定
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

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