计算化学公社

标题: 怎么计算分子间氢键键能？ [打印本页]

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2020-1-9 10:48
标题: 怎么计算分子间氢键键能？
请问老师，分子间氢键键能应该怎么算呢？一个分子含33个原子，另一个是甲醇。请问有合适的计算方法么？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-1-9 13:00
用Multiwfn做AIM分析，根据对应氢键的BCP的密度进行氢键键能估计，仔细看
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513（http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html）。

如果两个分子间的相互作用几乎只有一条氢键，以常规方式算分子间相互作用能亦可

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2020-1-9 13:05

sobereva 发表于 2020-1-9 13:00
用Multiwfn做AIM分析，根据对应氢键的BCP的密度进行氢键键能估计，仔细看
透彻认识氢键本质、简单可靠地估 ...

谢谢老师

作者
Author: Machaophy 时间: 2020-1-25 00:17
我觉得，应该是成健前后体系焓的变化吧
计算前后两个两个构型的热力学量，然后对比下

作者
Author: sobereva 时间: 2020-1-25 01:55

Machaophy 发表于 2020-1-25 00:17
我觉得，应该是成健前后体系焓的变化吧
计算前后两个两个构型的热力学量，然后对比下

纯理论方式研究氢键键能不需要考虑热力学量，也不需要优化结构

作者
Author: 东木 时间: 2022-8-10 11:34

sobereva 发表于 2020-1-9 13:00
用Multiwfn做AIM分析，根据对应氢键的BCP的密度进行氢键键能估计，仔细看
透彻认识氢键本质、简单可靠地估 ...

老师您好，JCC（2019）那篇文章里对42种氢键二聚体的前提描述是“分子量足够小的单体”。提主提到的含有33个原子的分子是否还能用电子密度ρ来计算氢键键能E。我优化出的四乙基醋酸铵、甲醇、甲乙酮应该算“大分子”，那这样的话四乙基醋酸铵和甲醇或者甲乙酮之间的氢键键能能通过电子密度计算么。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-8-11 06:46

东木发表于 2022-8-10 11:34
老师您好，JCC（2019）那篇文章里对42种氢键二聚体的前提描述是“分子量足够小的单体”。提主提到的含有3 ...

没有“分子量足够小的单体”这种前提条件
能

作者
Author: 东木 时间: 2022-8-11 10:57

sobereva 发表于 2022-8-11 06:46
没有“分子量足够小的单体”这种前提条件
能

好的老师，谢谢老师的回复。

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