计算化学公社

标题: 如何做出下面这种2D势能面图呢 [打印本页]

作者
Author:
qwe1832518773    时间: 2020-3-12 16:30
标题: 如何做出下面这种2D势能面图呢
看文献SCIENCE, 2004, 304, 992(文献在附件里)的时候看到作者画了一个2D势能面的图(下图)来说明右图的能垒比左图小,我觉得这种解释方法非常明了,想学习这种图是如何做出来的呢?除了势能等高线之外,图中的粗黑线是计算机生成的还是作者后期自己手画上去的呢?希望dalao们能指点一下,sob老师如果有详细的博文就更好了(自己搜了一下博客,没搜到。。。)
(, 下载次数 Times of downloads: 14)

作者
Author:
sobereva    时间: 2020-3-13 03:25
做个二维势能面扫描就完了,看
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html
例如我培训班里这个例子。右图是gview直接显示的,可以点右键把数据导出来,然后用origin、sigmaplot之类在绘制成等值线图。
(, 下载次数 Times of downloads: 20)

至于黑色的轨迹,跑从头算动力学,把轨迹的每一帧的两个变量随时间的变化提取出来,投影到等值线上就完了。

作者
Author:
qwe1832518773    时间: 2020-3-17 14:55
sobereva 发表于 2020-3-13 03:25
做个二维势能面扫描就完了,看
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474(http://bbs.kein ...

感谢sob老师解答!!




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3