计算化学公社

标题: 求助dimer里跃迁偶极夹角计算 [打印本页]

作者
Author: jiang012582 时间: 2020-5-22 18:55
标题: 求助dimer里跃迁偶极夹角计算
请问各位老师我算了一个dimer的单点，由于我怕优化后dimer距离改变，所以我就把dimer直接从晶体里抠出来了，然后算了个单点，我想计算两个分子的跃迁偶极矩的夹角，看看它是不是文献里面提到的H型聚集，下面是文献里面的图，但是我查看fchk文件，我的跃迁偶极矩很小很小，我点击result里面想把跃迁偶极矩显示出来但是发现那个跃迁偶极矩根本表示不出来，是因为跃迁偶极矩太小的原因吗？想问问大家有没有什么方法能够得到文献里面的这种dimer的跃迁偶极矩的夹角，谢谢大家

作者
Author: sobereva 时间: 2020-5-23 02:02
分清楚某个电子态的偶极矩和两个电子态之间的跃迁偶极矩，完全是八竿子打不着的两码事
你那个界面显示的是偶极矩，当前体系是近乎中心对称的，显然偶极矩近乎为0。

整体的跃迁偶极矩从输出文件里直接能读到，仔细看
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314（http://bbs.keinsci.com/thread-2413-1-1.html）

如果要得到特定片段的跃迁偶极矩，仔细看
使用Multiwfn+VMD绘制片段贡献的跃迁偶极矩矢量
http://sobereva.com/396（http://bbs.keinsci.com/thread-7459-1-1.html）

用Multiwfn算出来两个部分的跃迁偶极矩之后，自行根据几何关系可以求矢量的夹角

作者
Author: 哪有这么脆弱 时间: 2020-9-18 17:32

sobereva 发表于 2020-5-23 02:02
分清楚某个电子态的偶极矩和两个电子态之间的跃迁偶极矩，完全是八竿子打不着的两码事
你那个界面显示的是 ...

老师请问我根据帖子的步骤：进行source loaddip.tcl，显示 no such file or directory是什么原因。
还有老师您指的算出来两个部分的跃迁偶极矩是指，dimer中两个部分的跃迁偶极矩吗。看了您的帖子，对于我要计算的dimer，可以选择计算图中，12，23，34的跃迁偶极矩，进一步求得夹角吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-19 08:46

哪有这么脆弱发表于 2020-9-18 17:32
老师请问我根据帖子的步骤：进行source loaddip.tcl，显示 no such file or directory是什么原因。
还有 ...

文件不在当前目录下
当前是什么目录在VMD窗口里输入dir查看（假设windows版）

语义不明
下文计算的片段的跃迁偶极矩当然是你选的特定区域的跃迁偶极矩。计算你高亮的原子的跃迁偶极矩完全没有实际物理意义，要计算也是计算每个单体的
使用Multiwfn+VMD绘制片段贡献的跃迁偶极矩矢量
http://sobereva.com/396（http://bbs.keinsci.com/thread-7459-1-1.html）

作者
Author: 哪有这么脆弱 时间: 2020-9-19 10:08

sobereva 发表于 2020-9-19 08:46
文件不在当前目录下
当前是什么目录在VMD窗口里输入dir查看（假设windows版）

老师您的意思就是计算分别两个单体的跃迁偶极矩，然后再把两个单体的跃迁偶极矩整合起来成一个dimer的跃迁偶极矩吗

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-20 08:16

哪有这么脆弱发表于 2020-9-19 10:08
老师您的意思就是计算分别两个单体的跃迁偶极矩，然后再把两个单体的跃迁偶极矩整合起来成一个dimer的跃 ...

我不知道你的研究到底想算什么，我只能告诉你你想算的量具体怎么算

自行整合明显没有意义，dimer的跃迁偶极矩直接就是两个单体的跃迁偶极矩的加和，倘若你要算这个，直接按博文里的做法把片段定义为dimer部分就完了。

作者
Author: GF1995 时间: 2021-10-19 11:03
您好，可以分享一下这篇文献吗？谢谢

作者
Author: 三与三十万 时间: 2023-3-27 21:06
请问计算完两个单体的偶极矩之后如何测量两个偶极矩的夹角呢？

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