计算化学公社

标题: 多中心键级和跃迁偶极矩的问题 [打印本页]

作者
Author: 光学laser 时间: 2021-1-23 13:32
标题: 多中心键级和跃迁偶极矩的问题
本帖最后由光学laser 于 2021-1-23 13:34 编辑

请教老师：
1）多中心键级可以算芘、蒽基、这些多苯环的分子整体吗？老师说输入原子号要顺序排列，请教老师例如这个蒽基应该怎么输入原子号呢？
(, 下载次数 Times of downloads: 31)

2）按照sob老师帖子，multiwfn计算的分子各个片段跃迁偶极矩相加之和要比计算单个分子整体的大不少（6.9D和6.1D）请问老师，这样合理吗？

3）跃迁偶极矩的方向是从苯环到噻吩，可是ICT方向是噻吩到苯环，此二者方向有关系吗？（原先请教过，仍有些疑虑，感谢sob老师）

作者
Author: sobereva 时间: 2021-1-23 14:54
1 当然可以。按照你要考察的路径上的原子顺序写序号就完了

2 你的计算有问题，或者输入文件有问题，诸如没写IOp(9/40=4)等等

先严格重复文中的例子
使用Multiwfn+VMD绘制片段贡献的跃迁偶极矩矢量
http://sobereva.com/396（http://bbs.keinsci.com/thread-7459-1-1.html）

3 毫无关系，论坛里之前我就回复过类似问题

作者
Author: 光学laser 时间: 2021-1-23 22:49
本帖最后由光学laser 于 2021-1-23 23:41 编辑

sobereva 发表于 2021-1-23 14:54
1 当然可以。按照你要考察的路径上的原子顺序写序号就完了

2 你的计算有问题，或者输入文件有问题，诸如 ...

谢谢老师！有两个问题再追问下老师
1）您说”计算多中心键级在输入原子序号的时候必须按照连接关系“，但是有共用C键例如并苯，按照原子顺序排无法避免重算漏算呀（可能我理解不对）
如图示，如果想算三个苯环整体（菲）的多中心键级，例如输入 C11 13 14 15 8 9 10 7 3 4 5 6 1 2 那C8-C4 和C2-C3没有算进去，而首尾不应有的C11-C2却算进去了，请老师写一下这个分子整体的原子序号应该怎么写，我就应该明白自己哪理解错了，感谢sob老师！
(, 下载次数 Times of downloads: 31)

2）您在计算片段跃迁偶极矩里的例子 (, 下载次数 Times of downloads: 33) ，我算了一下模（平方和开根号），total约为2.89 而苯环1+N2+苯环2约为3.05 ，仍有误差，是不是精度问题（9/40=5）会更好呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-1-24 04:38

光学laser 发表于 2021-1-23 22:49
谢谢老师！有两个问题再追问下老师
1）您说”计算多中心键级在输入原子序号的时候必须按照连接关系“， ...

1 如果你要考察外面那个环的共轭特征，显然应当按照连接顺序输入9,10,7,3,2,1,6,5,4,8,15,14,13,11，干嘛把8 9、3 4写进去

2 显然是各个片段求矢量和才和total有可比性，明显不应当先求模再相加后对比

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