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标题: 丁二酸抽氢反应机理解释求助 [打印本页]

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星月无光    时间: 2021-2-22 10:49
标题: 丁二酸抽氢反应机理解释求助
大家好!
我在算2羟基-丁二酸氧化反应路径,就一个丁二酸,在C2位置加了一个羟基。
我想算的反应是,羟基自由基·OH夺走C2或C3位置上的氢,形成水和相应的自由基,我在算过渡态反应的时候C3位置上的抽氢反应可以找到过渡态,但是C2位置上的抽氢反应我试了好久也找不到过渡态。
所以,我想请教的是:我要用什么方法来解释抽氢反应发生在C3位置,而不能发生在C2位置,或者说C2位置上的抽氢反应比C3位置困难,刚接触量化,这样的反应也没找到相关文献,请各位多多帮忙,谢谢!



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sobereva    时间: 2021-2-22 11:30
先做个羟基氧与H4的柔性扫描,逐渐拉近距离,看是什么情况
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html
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wzkchem5    时间: 2021-2-22 11:38
可能C2处抽氢的活化能为0,所以找不到过渡态。可以用sob老师刚才说的柔性扫描的方法证明活化能确实为0,也就是说如果扫描出来的曲线是单调的,就是没有活化能。
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北大-陶豫    时间: 2021-2-22 11:41
我以为你给的苹果酸是氧化产物呢,还在想羟基拔丁二酸C2和C3氢有什么区别吗……看了半天才明白原来是反应物……建议把标题里丁二酸改成苹果酸……
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星月无光    时间: 2021-2-22 12:46
感谢sob老师和wzkchem5、陶豫的意见,按您的意思是我需要做一个分子中的H4与羟基自由基的柔性扫描是吧?

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wzkchem5    时间: 2021-2-22 14:05
星月无光 发表于 2021-2-22 12:46
感谢sob老师和wzkchem5、陶豫的意见,按您的意思是我需要做一个分子中的H4与羟基自由基的柔性扫描是吧?

嗯,是的
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星月无光    时间: 2021-2-22 17:30
再请教一个问题 我在柔性扫描的时候为什么是羟基在动,而不是氢在动啊?
羟基氧是16号原子,H是4号原子
# PM7 opt=modredundant nosymm
...略
4 16 S 17 -0.1
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wzkchem5    时间: 2021-2-22 18:05
星月无光 发表于 2021-2-22 17:30
再请教一个问题 我在柔性扫描的时候为什么是羟基在动,而不是氢在动啊?
羟基氧是16号原子,H是4号原子
# ...

羟基需要首先接近有机物,接近到一定程度,C-H键才会显著拉长,以至于发生氢原子转移。当羟基足够接近氢以后,就主要是氢在动了
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星月无光    时间: 2021-2-22 23:26
柔性扫描做完了,得到结果放在附件里,结果是H4和羟基自由基距离从2减小到1时,能量是单调减少的,这可以说明活化能为零,不存在过渡态吗?




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