计算化学公社

标题: Shermo 2.2发布 [打印本页]

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-17 14:49
标题: Shermo 2.2发布
下文介绍的Shermo程序今日发布了2.2版，现已可以在官网http://sobereva.com/soft/shermo/下载
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552（http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html）

此版本在settings.ini里增加了imode设置，当其设为1时，体系的平动和转动对热力学量的贡献将被忽略。这适合用于晶体、被吸附物的热力学计算，因为它们没有自由的平动和转动。

作者
Author: zsu007 时间: 2021-6-17 22:04
社长威武！

作者
Author: ChemG 时间: 2022-3-12 17:12
请问社长，有几个关于CP2K频率计算的小问题想请教您一下。在公社搜索一番，使用CP2K得到热力学数据的帖子有点少。
（1）对于金属氧化物slab化学吸附水合铁离子进行频率计算，使用PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH进行频率计算可以嘛？
（2）对于上述体系能否在PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH下优化并得到自由能校正量，再使用更高水平的单点得到更精确的电子能，二者相加得到比PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH频率更准确的自由能？
（3）原子数在300左右，PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH下使用OT优化很快，不知道频率计算能否算动呢。（您推荐的8173M双路工作站）
（4）上述表面吸附模型在计算频率的时候要固定材料，仅仅放开吸附质进行吗？
谢谢社长

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-13 04:40

ChemG 发表于 2022-3-12 17:12
请问社长，有几个关于CP2K频率计算的小问题想请教您一下。在公社搜索一番，使用CP2K得到热力学数据的帖子有 ...

1 最好带上D3

2 电子能量可以用TZ档次的

3 CP2K的Hessian是有限差分做的，要算6N次受力，N是不被冻结的原子数。可以根据算一次受力任务的耗时估计一下能不能吃得消

4 至少吸附位点处的基底原子不应该固定住

作者
Author: ChemG 时间: 2022-3-13 10:38

sobereva 发表于 2022-3-13 04:40
1 最好带上D3

2 电子能量可以用TZ档次的

非常感谢社长解答，1-3问题已经完全明白了。在第4个问题中，第一配位层的原子要被考虑，还需要考虑距离更远的原子嘛。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-14 02:04

ChemG 发表于 2022-3-13 10:38
非常感谢社长解答，1-3问题已经完全明白了。在第4个问题中，第一配位层的原子要被考虑，还需要考虑距离更 ...

更远的可以冻住

作者
Author: ChemG 时间: 2022-3-14 09:39

sobereva 发表于 2022-3-14 02:04
更远的可以冻住

收到，非常感谢社长解答

作者
Author: chenw 时间: 2022-3-19 22:59
选了B3LYP/def2-SVP做freq只找到sclZPE=0.9912，其他的校正因子用默认的1也是可以的吗？
J. Phys. Chem. A 2015, 119, 1701−1714

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-20 14:26

chenw 发表于 2022-3-19 22:59
选了B3LYP/def2-SVP做freq只找到sclZPE=0.9912，其他的校正因子用默认的1也是可以的吗？
J. Phys. Chem. A ...

可

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