计算化学公社

标题: 求助:噻吩环中的C-S共轭键键能计算 [打印本页]

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Ansir    时间: 2021-6-17 21:13
标题: 求助:噻吩环中的C-S共轭键键能计算
本帖最后由 Ansir 于 2021-6-17 21:14 编辑

    最近希望通过Guassian16计算噻吩,苯并噻吩,二苯并噻吩,苯硫醚,二苯二硫醚,己硫醇这些含硫化合物的C-S键键能,方法如下:
    DFT/M062X/6-31g(d,p),对其进行opt优化后找到其HF能量1,然后分类说明:
    1.己硫醇直接断开C-S键,计算两个片段自由基的HF能量2和3,键能为1-(2+3)的绝对值。
    2.苯硫醚和二苯二硫醚感觉S和苯环相连存在共轭,是直接断C-S键计算两个片段和硫醇计算方式相同,还是再设计一个共轭体系考虑共轭体系破坏的情况呢?(个人的感觉是可能不太需要,因为苯环整体的共轭没有被破坏?)
    3.噻吩,苯并噻吩和二苯并噻吩的C-S键明显处于共轭杂环中,可以通过旋转C-C键断开,但这就明显破坏了共轭,如果要补偿的话,应该设计什么样的体系来探究共轭破坏导致的能量变化呢?呋喃?环戊二烯?可我打断这些体系的C-O或C-C键,不也是相当于计算未知的C-O或C-C键键能么,怎么得到共轭破坏导致的那部分能量变化呢?
    论坛搜索中查到了  http://bbs.keinsci.com/thread-3085-1-1.html  此贴,但我的体系中没有多个C-S键,是否可以用普通体系如己硫醇中的C-S键键能和Laplacian键级进行计算?
    本人只是刚刚接触量化计算时间很短的菜鸟,还请各位高手指教!
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作者
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Ansir    时间: 2021-6-17 21:15
尴尬,己硫醇里少画了一个碳……
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fffff    时间: 2021-6-17 22:29
建议先看一下这几篇博文:
简谈量子化学中DFT泛函的选择http://sobereva.com/272
谈谈量子化学中基组的选择http://sobereva.com/336
浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组http://sobereva.com/387
对于普通有机体系一般可以B3LYP/6-31G*几何优化+频率分析,然后用M06-2X搭配3-zeta基组计算能量。即几何优化用小基组,能量计算用大基组。
ps:你图里画的BDE啥意思,如果是键解离焓的话,计算方法和键能不一样,见http://bbs.keinsci.com/thread-7362-1-1.html里李老师的回复
其他问题我不懂
还请大神指导
作者
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sobereva    时间: 2021-6-18 01:44
诸如噻吩那种情况,S-C和其它部分耦合太强,原理上就没法计算键能。必须给出个数的话,可以试图用能算C-S键能的情况和拉普拉斯键级的关系试图估计算不了的情况
作者
Author:
Ansir    时间: 2021-6-18 09:13
fffff 发表于 2021-6-17 22:29
建议先看一下这几篇博文:
简谈量子化学中DFT泛函的选择http://sobereva.com/272
谈谈量子化学中基组的选 ...

好的,谢谢指教!
作者
Author:
Ansir    时间: 2021-6-18 09:14
sobereva 发表于 2021-6-18 01:44
诸如噻吩那种情况,S-C和其它部分耦合太强,原理上就没法计算键能。必须给出个数的话,可以试图用能算C-S键 ...

好的,谢谢社长!




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