计算化学公社

标题: 弱相互作用体系结构优化有一些疑问 [打印本页]

作者
Author: luckylife 时间: 2021-11-8 19:29
标题: 弱相互作用体系结构优化有一些疑问
老师们好，弱相互作用体系优化结构时，单体和复合物优化开始用 m062x-d3优化，后来又想试用一下用mp2优化复合物的结构，那么可以直接用m062x-d3优化出的单体结构组成的复合物作为初始结构吗？我试验了一下，发现分别用mp2和m062x-d3这两种方法优化的单体作为初始结构，优化出的复合物结构有一些不同。我自己认为可以，但自己理论知识不够充足，还请各位大佬赐教。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-11-8 19:50
如果不同初始结构优化出来的结构不一样，说明这个体系有不止一个稳定结构，此时从任何初始结构优化都是不靠谱的（因为不知道是否找到了最稳定的结合构型），应当做构型搜索。
此外用MP2不如用双杂化泛函，计算量基本一样，但精度更高。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-11-8 21:34
本来单体在形成二聚体之后结构就会变化，一开始单体结构优化得再准，对于优化二聚体也没任何意义、好处。

直接在恰当的级别下去优化复合物结构就完了，如果二聚体可能不止一种构型，应当做构型搜索，看
构型和构象搜索程序Molclus主页：http://www.keinsci.com/research/molclus.html
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html

算这种问题没有任何理由用MP2，费力不讨好。优化弱相互作用体系比B3LYP-D3(BJ)或M06-2X没任何优势而耗时和资源消耗却远远高于之，而耗时相仿佛的双杂化泛函又显著比MP2更可靠。
仔细看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272（http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html）

一般弱相互作用复合物的优化用B3LYP-D3(BJ)就足够精确且可靠了，没必要再考虑其它的，见
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557（http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html）

作者
Author: luckylife 时间: 2021-11-9 11:12

wzkchem5 发表于 2021-11-8 19:50
如果不同初始结构优化出来的结构不一样，说明这个体系有不止一个稳定结构，此时从任何初始结构优化都是不靠 ...

好的，谢谢老师

作者
Author: luckylife 时间: 2021-11-9 11:13

sobereva 发表于 2021-11-8 21:34
本来单体在形成二聚体之后结构就会变化，一开始单体结构优化得再准，对于优化二聚体也没任何意义、好处。
...

谢谢sob老师

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)