计算化学公社

标题: CGENFF经常维护，有替代网站吗？ [打印本页]

作者
Author: vandenberg 时间: 2021-12-22 10:13
标题: CGENFF经常维护，有替代网站吗？
CGENFF网站经常维护，有charm替代网站可以建小分子的top吗？

作者
Author: panernie 时间: 2021-12-22 15:22
Chramm-Gui

作者
Author: vandenberg 时间: 2021-12-22 15:56
thanks

作者
Author: valiente1 时间: 2023-5-17 16:55
维护多久才会开放啊

作者
Author: superrice 时间: 2023-5-17 17:14
AuToFF工具可以帮助用户生成top文件，目前可以轻松实现分子建模和力场拓扑文件生成，此外已经支持现有的主流力场（GAFF、CVFF、OPLS、CGenFF）、二代力场(CFF、COMPASS)、通用力场形式(UFF、Dreiding)、联合原子力场（TraPPE-UA、OPLS-UA、GROMOS）、13种水模型力场等，详情请见http://bbs.keinsci.com/thread-37281-1-1.html

作者
Author: hugromacs 时间: 2025-5-31 03:04

superrice 发表于 2023-5-17 17:14
AuToFF工具可以帮助用户生成top文件，目前可以轻松实现分子建模和力场拓扑文件生成，此外已经支持现有的主 ...

确实挺好，但是无法生成CGenFF的电荷，有没有推荐电荷的计算，不知道用什么准确一些呢

作者
Author: sobereva 时间: 2025-5-31 07:58

hugromacs 发表于 2025-5-31 03:04
确实挺好，但是无法生成CGenFF的电荷，有没有推荐电荷的计算，不知道用什么准确一些呢

用RESP或RESP2(0.5)电荷
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441（http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html）
计算RESP原子电荷的超级懒人脚本（一行命令就算出结果）
http://sobereva.com/476（http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html）
RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/531（http://bbs.keinsci.com/thread-16190-1-1.html）
ORCA结合Multiwfn计算RESP、RESP2和1.2*CM5原子电荷的懒人脚本
http://sobereva.com/637（http://bbs.keinsci.com/thread-28178-1-1.html）

虽然RESP电荷不是CGenFF标配的，但在基本原理层面上能兼容

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)