计算化学公社

标题: 对于用MP2加色散校正的问题 [打印本页]

作者
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xiaofeixia    时间: 2022-2-1 13:41
标题: 对于用MP2加色散校正的问题
文章的修改意见上写的是:Comment 6: Noneof DFT methods utilized by the authors use the dispersion correction, which isnow a standard in the calculations of intermolecular interactions with DFT.  我的体系算的是MCO3···HF/XF (M = Zn, Gd; X=F, Cl, Br, I)形成的氢键或卤键,然后MCO3···N-bases (HCN, CH2NH,and NH3)形成的spodium bond,以及两个作用之间形成三体的协同,对于我想加色散,输入文件应该如何修改,我的输入文件是如上所示,结果输出文件报错,希望得到老师解答

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yflchx    时间: 2022-2-1 14:56
本帖最后由 yflchx 于 2022-2-1 23:19 编辑

1. 审稿意见里面写的是DFT,分清楚DFT和MP2。

2. DFT族群加D很容易,看手册,应用极为广泛,也被普遍接受,选泛函的时候注意挑选一下。

3. MP2加D需要特殊处理,仅限于方法学的倒腾,并没有什么应用优势。【补充:一个潜在的可能性是也许更适合对HF成分需求特别高的场合。】
作者
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sobereva    时间: 2022-2-1 21:10
如果是审稿人没好好看文章,没注意看你用的是MP2,直接明确告诉审稿人当前用的是MP2。MP2本身能考虑色散作用,但是考虑得并不怎么样。这年头还用MP2算弱相互作用几乎是自找comment,但凡能用得动MP2的时候记得一定要用双杂化泛函,诸如Gaussian里能用的revDSD-PBEP86-D3(BJ)就很理想,看
Gaussian中非内置的理论方法和泛函的用法
http://sobereva.com/344http://bbs.keinsci.com/thread-3997-1-1.html
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html

至于DFT怎么加D3仔细看
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210
不要用什么“加色散”这种语义不明的说法。色散和色散校正在语义上完全是两码事。

对于MP2,由于其描述色散作用不怎么样,所以也有人提出给其加色散校正的方法,见J. Chem. Theory Comput. 2018, 14, 4711−4721,是给其加了DFT-D3校正,称为MP2D,结果比B3LYP-D3(BJ)强一点。然而此文居然没有和任何带色散校正的双杂化进行对比,因此无法证明MP2D有任何实用价值。
作者
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yflchx    时间: 2022-2-3 09:42
本帖最后由 yflchx 于 2022-2-3 10:03 编辑

补一篇新出的文章:SCS-MP2D,里面也比较了MP2D,二者比较SCS-MP2D更胜一筹。当然,这还是属于方法学上的倒腾。

C. Greenwell et al. Spin-component-scaled and dispersion-corrected second-order Møller–Plesset perturbation theory: a path toward chemical accuracy. (in press) https://doi.org/10.1039/D1CP04922D

按照论文中提供的计算方法SCS-MP2D需要aTZ结合aQZ外推到CBS。
而用revDSD-PBEP86-D3(BJ)的话,直接结合def2-QZVP就很理想了(见这篇论文中的列表),和楼上的推荐一致。

应用的话最好还是依据 简单 有效 的原则。

作者
Author:
sobereva    时间: 2022-2-3 20:04
yflchx 发表于 2022-2-3 09:42
补一篇新出的文章:SCS-MP2D,里面也比较了MP2D,二者比较SCS-MP2D更胜一筹。当然,这还是属于方法学上的倒 ...

我觉得倒腾这些东西真是很无聊
本来双杂化就比MP2明显更好,DSD类泛函也已经引入了spin component scaled的思想,现在反过来再去折腾反倒更原始的SCS-MP2,明显没希望搞出新的有实用意义的东西。按理说MP2D、SCS-MP2D应当是在带DFT-D的双杂化之前出现的东西,十几年前该出现的东西居然现在才发表




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