计算化学公社

标题: MS可以计算分子自由体积吗？ [打印本页]

作者
Author: Sasuke 时间: 2022-4-26 22:17
标题: MS可以计算分子自由体积吗？
请问下MS可以计算分子的自由体积吗？具体怎么操作呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-27 05:26
说清楚你所谓的分子自由体积是怎么定义的，要算什么体系。单个分子没有自由体积的概念

单分子顶多说孔洞，Multiwfn可以算
使用Multiwfn可视化分子孔洞并计算孔洞体积
http://sobereva.com/408（http://bbs.keinsci.com/thread-9331-1-1.html）

如果是动力学模拟的盒子中的自由体积，下文做法可以计算和展示
使用Multiwfn图形化展示分子动力学模拟体系中的孔洞、自由区域
http://sobereva.com/539（http://bbs.keinsci.com/thread-16491-1-1.html）
使用Multiwfn计算晶体结构中自由区域的体积、图形化展现自由区域
http://sobereva.com/617（http://bbs.keinsci.com/thread-25241-1-1.html）

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