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标题: 求助对两个片段之间的质心距离或者几何中心距离进行扫描 [打印本页]

作者
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静静子    时间: 2022-5-21 15:35
标题: 求助对两个片段之间的质心距离或者几何中心距离进行扫描
各位老师好,本人最近想要研究某个分子内部两个片段之间的距离与一个性质的影响,通过分子结构微调有点小结论,现在想要做个有关两个片段之间距离的势能面扫描,之前在multiwfn中计算过两个片段之间的质心距离和几何中心距离,不知我是否能够对这两个片段之间的质心距离或者几何中心距离进行扫描?感谢各位老师多多指点~
作者
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sobereva    时间: 2022-5-22 01:55
这肯定得柔性扫描。利用下文说的基于Gaussian的GIC做柔性扫描可以实现你的目的
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html
作者
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静静子    时间: 2022-5-25 10:03
sobereva 发表于 2022-5-22 01:55
这肯定得柔性扫描。利用下文说的基于Gaussian的GIC做柔性扫描可以实现你的目的
详谈使用Gaussian做势能面 ...

感谢老师的回复,看了帖子一般是基于分子内的某个键长或者二面角去扫描,而我想用分子内部两个片段的质心距离去进行扫描,不知是否可行?可以用设置虚原子的方式嘛?
作者
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sobereva    时间: 2022-5-26 06:04
静静子 发表于 2022-5-25 10:03
感谢老师的回复,看了帖子一般是基于分子内的某个键长或者二面角去扫描,而我想用分子内部两个片段的质心 ...

我不都说了用GIC,完整、一个字一个看完博文,明明都给了现成的例子“6.1 GIC扫描实例1:水+氮气二聚体的几何中心距离扫描”




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