计算化学公社

标题: 请问有没有可以计算局部自由体积的方法 [打印本页]

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Author: 夜千 时间: 2022-7-15 21:57
标题: 请问有没有可以计算局部自由体积的方法
本帖最后由夜千于 2022-7-16 10:00 编辑

各位老师好，我所计算的是一个局部的开放碗状结构（非蛋白），想给碗上方开放空间建模，计算他的自由体积。用了一些计算蛋白质口袋的工具，似乎都不太合适。

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Author: sobereva 时间: 2022-7-15 21:59
使用Multiwfn可视化分子孔洞并计算孔洞体积
http://sobereva.com/408（http://bbs.keinsci.com/thread-9331-1-1.html）

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Author: 夜千 时间: 2022-7-16 10:01

sobereva 发表于 2022-7-15 21:59
使用Multiwfn可视化分子孔洞并计算孔洞体积
http://sobereva.com/408（http://bbs.keinsci.com/thread-933 ...

老师好，我用这个计算，只能算出来一个域，就是整个box,是我的输入文件有问题吗

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Author: sobereva 时间: 2022-7-16 10:03

夜千发表于 2022-7-16 10:01
老师好，我用这个计算，只能算出来一个域，就是整个box,是我的输入文件有问题吗

你对用法的理解有问题
仔细看博文里的例子，搞明白此功能的思想

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