计算化学公社

标题: 求助Gaussian计算内存不够 [打印本页]

作者
Author:
小翟w    时间: 2022-10-21 09:14
标题: 求助Gaussian计算内存不够
老师们,打扰一下,想问问,这是我的输入文件还有输出文件后面的部分,(因为文件太大,只能截图了),我之前是只有%mem=8GB,算出结果表明内存不够,我加了%mem=60MW,还是不够,想问问要继续加%mem=60MW,还是要怎样修改一下。麻烦各位老师指导一下。

作者
Author:
zjxitcc    时间: 2022-10-21 09:34
本帖最后由 zjxitcc 于 2022-10-21 09:51 编辑

(1)%mem是用来指定内存的,60MW相当于480MB,远小于8GB,做计算不要抠门,一台节点上有多少内存,全写上去(比如有100GB可用,你就写%mem=85GB,一般一台节点就1个人用,所以你把内存放着也没人可以用),用free -g或free -h命令查看当前机器内存情况。

(2)至于硬盘,一般不需要在输入文件里指定。建议运行df -h和echo $GAUSS_SCRDIR检查一下高斯临时文件目录是不是快满了,以前没用的残留文件都可以删了。

(3)不要既写%mem=8GB又写%mem=60MW。

(4)如今是2022年,不是2002年,做MP2/aug-cc-pVTZ计算没有意义,你这个还用MP2做opt+freq,更是没有意义(除非你就是想展示MP2结果挺垃圾的,可以这么算),尤其是还没用上RI-MP2。做应用型计算,直接用CCSD(T)算高精度单点,如果传统CCSD(T)算不动,就要做DLPNO-CCSD(T)计算。

作者
Author:
小翟w    时间: 2022-10-21 10:58
好的,谢谢老师,醍醐灌顶,我修改一下重新提交看看
作者
Author:
sobereva    时间: 2022-10-21 19:34
MP2算有机体系已经像是古人穿越过来的,拿MP2算带过渡金属的更是自找挨批。MP2结合这么大基组算freq还极其昂贵,完全是费力不讨好。

该用什么好好看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html

此体系opt freq用PBE0-D3(BJ)/def2-TZVP就妥妥的,也不昂贵

作者
Author:
小翟w    时间: 2022-10-28 22:16
(, 下载次数 Times of downloads: 0) (, 下载次数 Times of downloads: 1)
我加内存了,依然是这个样子,是不是结构不对,让他们强制对称了?

作者
Author:
zjxitcc    时间: 2022-11-23 14:13
小翟w 发表于 2022-10-28 22:16
我加内存了,依然是这个样子,是不是结构不对,让他们强制对称了?

输出文件没有报错信息。有两点建议:
(1)输入文件中用#p而非#,输出更多信息,便于监控计算进度或找错误。
(2)还是那句话,当前计算级别过于古老,不建议再这么算下去。如果你不知道什么方法合适,可以问大家,但不要闭门造车。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3