计算化学公社

标题: 求助：Gaussian可以做分子筛的吸附吗 [打印本页]

作者
Author: kuroha 时间: 2023-1-16 19:16
标题: 求助：Gaussian可以做分子筛的吸附吗
课题组做分子筛吸附气体的（催化），想问下Gaussian可以做这类计算吗，比如分子筛（MFI,ZSM-5,FAU等）吸附CO2这种类型；
自学了几节课感觉Guassian更偏向有机小体系的计算，包括过渡态和能量计算；
如果能做有什么文章或者例子可以参考吗？如果Guassian不能做又是那些软件可以做，MS吗？
本人小白，刚接触量子化学，恳请大家指点。

作者
Author: yjb 时间: 2023-1-16 20:07
可以把孔道活性位点附近的原子纳入QM区域，外围的用MM来描述，用QM/MM的方法，高斯里面是ONIOM的方法，但是这种方法本身存在一些计算上的误差。

作者
Author: niobium 时间: 2023-1-16 20:16
搜ONIOM zeolite，会出来一大堆文献

作者
Author: Q-Chembio-llg 时间: 2023-1-16 22:00
如果不想用高斯的话可以考虑VASP

作者
Author: kuroha 时间: 2023-1-16 23:06

Q-Chembio-llg 发表于 2023-1-16 22:00
如果不想用高斯的话可以考虑VASP

有点小白，不知道如何用高斯来做，自学的课程没见过处理分子筛这种大体系，请问有什么教程或者论文能拜读吗？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-1-16 23:09

kuroha 发表于 2023-1-16 16:06
有点小白，不知道如何用高斯来做，自学的课程没见过处理分子筛这种大体系，请问有什么教程或者论文能拜读 ...

楼上已经有人给了搜索的关键词了，自己搜一下就有文献

作者
Author: sobereva 时间: 2023-1-17 05:21
好好记住Gaussian怎么拼

用簇模型，从分子筛中挖出一块，对边界饱和，优化时冻结边界原子，用Gaussian计算完全没问题。结合ONIOM也可以，但不是必须的，用ONIOM还麻烦，看下文
要善用簇模型，不要盲目用ONIOM算蛋白质-小分子相互作用问题
http://sobereva.com/597

更多的关于簇模型的Gaussian计算看
18碳环（cyclo[18]carbon）与石墨烯的相互作用：基于簇模型的研究一例
http://sobereva.com/615（http://bbs.keinsci.com/thread-25306-1-1.html）
使用量子化学程序基于簇模型计算金属表面吸附问题
http://sobereva.com/540（http://bbs.keinsci.com/thread-16532-1-1.html）
以及下文的MOF-5的簇模型
Multiwfn使用的高效的静电势算法的介绍文章已于PCCP期刊发表！
http://sobereva.com/614（http://bbs.keinsci.com/thread-24940-1-1.html）

若当周期性计算强烈建议用又免费又巨快的CP2K。北京科音的CP2K培训里都有现成的例子

(, 下载次数 Times of downloads: 12)

之后还可以结合Multiwfn做诸多分析考察相互作用，诸如IGMH（《使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用》http://sobereva.com/621）

不建议M$，又贵又慢又不灵活
VASP卖得也很贵，速度还明显不及CP2K，还没法结合Multiwfn做各种波函数分析

作者
Author: kuroha 时间: 2023-1-17 13:13

sobereva 发表于 2023-1-17 05:21
好好记住Gaussian怎么拼

用簇模型，从分子筛中挖出一块，对边界饱和，优化时冻结边界原子，用Gaussian计 ...

好的好的感谢sob大大，我认真看看！

作者
Author: reid 时间: 2023-2-14 22:48
还是建议用cp2k，很容易。另外，也可以跑一下动力学，看看吸附什么的

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