计算化学公社

标题: 求助：在课题组的服务器上跑orca算到一半中断了 [打印本页]

作者
Author: 风风光风光 时间: 2023-3-30 14:42
标题: 求助：在课题组的服务器上跑orca算到一半中断了
各位老师们，我们组里服务器上装了orca503和openmpi411，服务器有112个核内存情况如下图。这两天我在服务器上跑任务没跑完进程就消失了，且有很多临时文件。
分别做了一个紫外计算和一个结构优化，结构优化在自己的虚拟机上跑就没有问题，转到服务器上就不行了.

紫外计算卡到下面这一步进程就消失了，但关闭终端显示进程还未结束
998 0.0000 1620.653735    44100.2301
999 0.0000 1620.654199    44100.2428
1000 0.0000 3787.289132 103057.3766
1001 0.0000 3787.289580 103057.3888
1002 0.0000 9297.374458 252994.4210
1003 0.0000 9297.374885 252994.4326
1004 0.0000 38550.572328 1049014.4039
1005 0.0000 38550.573019 1049014.4227
Total SCF time: 0 days 0 hours 49 min 12 sec

Maximum memory used throughout the entire SCF-calculation: 324.2 MB

结构优化的文件报错如下，核数已经根据以往问这个问题的帖子改很小了
1080 0.0000    118.725563    3230.6868
1081 0.0000    118.733693    3230.9080
Total SCF time: 0 days 1 hours 0 min 17 sec

Maximum memory used throughout the entire SCF-calculation: 332.1 MB

ORCA finished by error termination in SCF
Calling Command: mpirun -np 2  /home/c427/orca503/orca_scf_mpi S0.gbw b S0
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465]:
  .... aborting the run

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-3-30 16:42
检查openmpi安装是否有问题

作者
Author: abin 时间: 2023-3-30 17:30
试试这个方案

http://bbs.keinsci.com/thread-26418-1-1.html

如果也保存，
猜测可能是输入文件问题，或者bug

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)