计算化学公社
标题:
r2scan-3c优化过渡金属化合物出现的虚频值极大
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作者Author:
neon
时间:
2023-8-4 12:56
标题:
r2scan-3c优化过渡金属化合物出现的虚频值极大
大家好,我想用计算过渡金属化合物的spin state splitting energy, 目前用r2scan-3c 优化一45个原子的含Fe的化合物,初始结构是用gfn2-xtb优化的,但是从优化后的结果来看,频率计算含有一个很大的虚频,把.out文件用OfakeG转换后,导入gaussView观察振动模式,发现除了整个分子振动外,箭头所指的O-H键剧烈左右摇摆,相同结构利用b97-3c优化,未发现任何异常,想问一下该如何解释这个虚频,因为测试过很多类似的结构,发现r2scan-3c优化的含铁化合物都含有一个巨大的虚频值,另外,guassview页面底部显示这是一个neutral, singlet, 但实际输入文件是+2,5 的high-spin state complex.
作者Author:
yxdd98
时间:
2023-8-4 13:03
本帖最后由 yxdd98 于 2023-8-4 13:07 编辑
没有叫
guassview的程序,窗口显示的只是软件对当前体系的判断,如果与实际不符自己在输入文件里修改就成
尝试过消除虚频的各类方法了吗?另外对于r2SCAN-3c可以看
ORCA 5.0.4发布 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 - 第2页 (keinsci.com)
的讨论
作者Author:
sobereva
时间:
2023-8-4 15:36
你的截图里明明是B97-3c
作者Author:
neon
时间:
2023-8-4 21:55
谢谢大家的回复,之前有试过sobereva老师帖子的建议,比如提高收敛限,使用精确的hessian计算,但都得到类似的结果,也试过楼上给的建议,使用defgrid3,并做图片中scf设置,但结果还是还有巨大的虚频值。抱歉,放错截图了,但虚频值的确是出现在r2sacn-3c计算中,二者的参数设置完全一样,只是所用方法分别为b97-3c 和r2scan-3c。 没有找到图片修改的地方,抱歉无法修改图片错误。
作者Author:
sobereva
时间:
2023-8-4 22:08
neon 发表于 2023-8-4 21:55
谢谢大家的回复,之前有试过sobereva老师帖子的建议,比如提高收敛限,使用精确的hessian计算,但都得到类 ...
如果B97-3c没虚频用B97-3c就完了,对于几何优化目的,r2SCAN-3c不会比B97-3c有明显优势。而如果B97-3c表现很不好的情况(比如对自相互作用误差敏感的体系),用r2SCAN-3c也肯定好不了。我不认为r2SCAN-3c用于opt freq目的比B97-3c有明显额外价值。
作者Author:
chrinide
时间:
2023-8-5 06:46
scan类的所有泛函都有数值问题,对DFT格点要求非常高,如果非要用,建议用更加稳健保守的大格点。而B97-3c是非常数值稳定的泛函,默认格点就可以了。
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