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楼主 Author: wzkchem5
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[ORCA] ORCA 5.0.4发布

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发表于 Post on 2023-3-4 10:59:59 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ghifi37 于 2023-3-4 11:01 编辑

请问这个bug是ORCA的bug吧?而不是D4本身的?虽然在ORCA里谨慎用D3到现在,但还是在第一性原理计算中用了很久的D4了。
orcaforum.kofo.mpg.de上不去,只能借此一问了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-4 17:33:59 | 只看该作者 Only view this author
ghifi37 发表于 2023-3-4 03:59
请问这个bug是ORCA的bug吧?而不是D4本身的?虽然在ORCA里谨慎用D3到现在,但还是在第一性原理计算中用了很 ...

应该不是D4本身的
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2023-3-4 18:20:24 | 只看该作者 Only view this author
应该不是D4本身的问题,我也是发现oca的结果比较奇怪,试试新版的

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发表于 Post on 2023-3-4 19:22:54 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-4 17:33
应该不是D4本身的

谢谢回复!这下就放心了,不过我也留意着点D4有什么风吹草动。

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发表于 Post on 2023-3-5 00:34:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 dnlx 于 2023-3-5 02:25 编辑

我前面的问题(正庚烷质子化),5.0.4的结果一切正常。
可见不是D4模型的问题,而是代码有bug

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发表于 Post on 2023-3-14 17:31:08 | 只看该作者 Only view this author
毕业了,用ORCA算的论文还没发。老师写我名字不算侵权吧

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发表于 Post on 2023-3-15 19:44:30 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 牧生 于 2023-3-15 20:32 编辑

win版
链接:https://pan.baidu.com/s/1XL9oal5yGUNkzaFBvmF3PA
提取码:8qq9

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发表于 Post on 2023-4-7 20:36:07 | 只看该作者 Only view this author
王老师好,我最近使用的版本是504,但是优化时遇到一些奇怪的现象,比如我用r2scan-3c 优化时经常遇到羰基/双键 微颤一百多步,最终优化失败的情况。

oss外链,优化轨迹播放-录屏

我用g16 external 优化也是如此

请问,504目前是有梯度bug吗?如果有,是整体的bug还是D4的问题?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-7 21:35:15 | 只看该作者 Only view this author
鬼隐 发表于 2023-4-7 13:36
王老师好,我最近使用的版本是504,但是优化时遇到一些奇怪的现象,比如我用r2scan-3c 优化时经常遇到羰基/ ...

r2SCAN-3c因为是meta-GGA,对格点比较敏感,可能是格点不够大
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发表于 Post on 2023-4-9 00:46:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 喵星大佬 于 2023-4-9 00:48 编辑

任何情况下defgrid3几乎必须,默认设置带着defgrid3,且scf如下设置
  1. %scf
  2. TolE          1e-10
  3. TolRMSP 1e-10
  4. TolMaxP   1e-8
  5. Thresh      1e-12
  6. TCut         1e-14
  7. end
复制代码


瓜丝在导数任务强制要求conver=8且默认设置的积分截断和ultrafine格点是非常有必要的
即使在用orca或其他软件时此类设置建议一律设严
如果通过降低此类要求快速得到一个不知道对不对的结果,不如不要得到结果

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-9 16:20:29 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2023-4-8 17:46
任何情况下defgrid3几乎必须,默认设置带着defgrid3,且scf如下设置

对于r2SCAN-3c确实如此。我可以考虑在我们内部反映一下,对于meta-GGA(或者只对于Minnesota泛函和SCAN系列泛函)把默认格点加到defgrid3。
对于普通GGA泛函,我们的测试结果是大概每几千个分子里会出现一例有假虚频的情况,且没有遇到过因为格点太小结构优化不收敛的情况。至于几千分之一的概率是否足以使得orca的默认格点必须改成defgrid3,我不好下结论,这个也看一下大家的意见。
至于scf的设置,我感觉verytightSCF基本足够了(tolE和tolRMSP比你写的松一个量级)。如果有verytightSCF不够,而你这个设置却够的情况,也欢迎反馈,我们可以考虑在verytightSCF和extremeSCF之间增加一个收敛阈值选项
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2023-4-9 17:21:39 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-9 16:20
对于r2SCAN-3c确实如此。我可以考虑在我们内部反映一下,对于meta-GGA(或者只对于Minnesota泛函和SCAN系 ...

我这个收敛标准是直接照搬了瓜丝里的scf=conver=8,加入这样一个设置可以让之前瓜丝的用户过度的更丝滑

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发表于 Post on 2023-4-9 18:13:23 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2023-4-9 17:21
我这个收敛标准是直接照搬了瓜丝里的scf=conver=8,加入这样一个设置可以让之前瓜丝的用户过度的更丝滑

scf(conver=8) 应该是 RMSP 1e-8, MaxP 1e-6,且高斯不检查TolE

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发表于 Post on 2023-5-31 23:53:51 | 只看该作者 Only view this author

连接失效了,能麻烦您再发一个么。也不行,下载太慢了,总是断掉!

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发表于 Post on 2023-6-1 00:17:25 | 只看该作者 Only view this author
ZhBao 发表于 2023-5-31 23:53
连接失效了,能麻烦您再发一个么。也不行,下载太慢了,总是断掉!

http://bbs.keinsci.com/forum.php ... =%C4%E6%EA%AA%BE%A8

  1. 链接:http://pan.baidu.com/s/1c2hEk1a 密码:c26o
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