计算化学公社

标题: 模拟水表面张力,与实验值差别较大 [打印本页]

作者
Author:
五好先森    时间: 2023-9-6 20:24
标题: 模拟水表面张力,与实验值差别较大
本帖最后由 五好先森 于 2023-9-6 20:31 编辑

我用Gromcas模拟298K,1atm下水(spc/e模型)的表面张力,为60 mN/m,与社长的文章(https://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract29166.shtml)中结果相符,但是都明显小于实际测量值(~70 mN/m)。

但是有些文献中用LAMMPS,能得到非常接近实际值的水表面张力,如:https://doi.org/10.1021/jp048773n,该文献用的是F3C水模型。

请问,利用Gromacs能获得更准确的表面张力结果吗?是不是我只能改学LAMMPS了。

作者
Author:
thou    时间: 2023-9-6 22:39
http://bbs.keinsci.com/thread-25479-1-1.html
不同水模型对表面张力的重现性有差异
作者
Author:
五好先森    时间: 2023-9-7 08:34
thou 发表于 2023-9-6 22:39
http://bbs.keinsci.com/thread-25479-1-1.html
不同水模型对表面张力的重现性有差异

多谢提点。我主要关注油水界面张力,看来得多尝试几种水模型了。
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-9-8 01:33
直接用OPC就完了,算各种属性都很好
跟程序本身毫无关系,而GROMACS效率远高于LAMMPS,毫无换LAMMPS的意义
作者
Author:
五好先森    时间: 2023-9-8 08:44
sobereva 发表于 2023-9-8 01:33
直接用OPC就完了,算各种属性都很好
跟程序本身毫无关系,而GROMACS效率远高于LAMMPS,毫无换LAMMPS的意义

社长好,我换了OPC水模型计算水的表面张力,298 K、1 atm条件下结果为73.49 mN/m,基本符合实验值(~70 mN/m),比SPC/E更准确。但是用OPC水模型计算的298 K、1 atm条件下水-正癸烷界面张力为58.00 mN/m,与实验值(51.98 mN/m)的偏差大于SPC/E水模型计算结果(52.21 mN/m)。

这让我感到有些纠结,当既要关注油-水界面张力又要关注水表面张力的情况下,担心统一都用OPC会导致界面张力偏差较大,能不能分情况使用两种模型啊?这样做又害怕会被质疑。
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-9-8 14:37
五好先森 发表于 2023-9-8 08:44
社长好,我换了OPC水模型计算水的表面张力,298 K、1 atm条件下结果为73.49 mN/m,基本符合实验值(~70 m ...

如果确信误差就是来自于水模型而不是其它因素,也可以尝试OPC3或TIP4P-FB,看是否有更均衡的描述
作者
Author:
五好先森    时间: 2023-9-8 19:36
sobereva 发表于 2023-9-8 14:37
如果确信误差就是来自于水模型而不是其它因素,也可以尝试OPC3或TIP4P-FB,看是否有更均衡的描述

明白明白,多谢社长。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3