计算化学公社

标题: 求助计算后过渡元素配合物的溶剂化问题 [打印本页]

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qazwer    时间: 2023-9-14 02:25
标题: 求助计算后过渡元素配合物的溶剂化问题
求助各位老师,已经看过http://sobereva.com/327这篇帖子,现在遇到了一点小问题:我在计算几个配合物体系的溶解自由能,含有C,H,O,N,F,Ir,Ru。使用smd模型,但是文中推荐的6-31G*基组似乎没有定义到Ir。请问这种情况该怎么办呢?

我换用M062X/def2TZVP基组,但是两个文件(真空和加溶剂化模型)算出的电子能量差足足有0.25 Hartree,这明显是哪里出了问题。


附件给出了全部的计算文件,含结构优化。求助各位大佬。

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sobereva    时间: 2023-9-14 02:55
Ir、Ru用SDD之类
仔细看
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html

算过渡金属配合物用M06-2X是缺乏最基本常识的表现,仔细看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html

上传文件时主动说清楚各个文件对应什么,别让别人猜

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qazwer    时间: 2023-9-15 08:55
本帖最后由 qazwer 于 2023-9-15 08:57 编辑
sobereva 发表于 2023-9-14 02:55
Ir、Ru用SDD之类
仔细看
谈谈赝势基组的选用

我的体系是一个过渡金属配合物,结构优化是用的b3lyp加混合基组,原先算溶剂化能用的是M062X+def2TZVP。

您的意思是应该算溶剂化能用M052X+6-31G*+sdd赝势吗?感谢回复!

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wzkchem5    时间: 2023-9-15 15:07
qazwer 发表于 2023-9-15 01:55
我的体系是一个过渡金属配合物,结构优化是用的b3lyp加混合基组,原先算溶剂化能用的是M062X+def2TZVP。
...

如果M06-2X不行,那M05-2X也不行。问题在于HF exchange太多,而不在于是06还是05。
所谓的”SMD溶解自由能只能在M05-2X/6-31G(d)级别下算“不是严格的规则,如果有其他不适合用M05-2X或M06-2X的因素存在,那么必须做权衡。至于具体需要多不适合用M05-2X或M06-2X才应该改用其他泛函,没有明确规则,一般靠自己经验、文献做法或benchmark计算确定
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qazwer    时间: 2023-9-15 21:57
wzkchem5 发表于 2023-9-15 15:07
如果M06-2X不行,那M05-2X也不行。问题在于HF exchange太多,而不在于是06还是05。
所谓的”SMD溶解自由 ...

一针见血的建议,明白了,感谢!!




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