计算化学公社

标题: 求助：计算阳离子和水法线的夹角 [打印本页]

作者
Author: xjw 时间: 2023-11-6 14:07
标题: 求助：计算阳离子和水法线的夹角
老师，我在文献中看到过计算一个阳离子和水法线夹角的分布，如下图所示，里面的示意图即为所求角，我在求解距离，角度，二面角随时间变化以及分布的VMD脚本 - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算化学公社 (keinsci.com)这个博文中有看到过求角的分布的，但是我不太清楚怎么表示水法线这个矢量，请问应该怎么改上面博文中得到我想要的数据啊？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-7 09:07
两个O-H键对应矢量之和就是了

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