计算化学公社

标题: 关于石墨烯吸附醛氟有机污染物的基组选择的问题 [打印本页]

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RgH    时间: 2023-12-22 13:51
标题: 关于石墨烯吸附醛氟有机污染物的基组选择的问题
想问下各位老师,我在做下图石墨烯吸附有机物的计算中,计算出来的吸附能数值很奇怪,以下是我选用的基组:优化用的是opt freq b3lyp/6-31g(d,p) scrf=(solvent=water) em=gd3bj,计算能量用的是m062x/def2tzvp scrf=(smd,solvent=water) em=gd3,这样的基组选择是否可行。

作者
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pal    时间: 2023-12-22 14:15
石墨烯太小了吧,O看起来都和饱和边界的H作用了
作者
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sobereva    时间: 2023-12-22 16:42
模型明显不当。参考下文的讨论
18碳环(cyclo[18]carbon)与石墨烯的相互作用:基于簇模型的研究一例
http://sobereva.com/615http://bbs.keinsci.com/thread-25306-1-1.html

def2-TZVP不考虑counterpoise算物理吸附完全不行。至少得用counterpoise修正BSSE问题
计算化学键键能时考虑BSSE不仅是多余的甚至是有害的
http://sobereva.com/381http://bbs.keinsci.com/thread-6047-1-1.html

从下文2.3节的相互作用能计算平均误差(MAE)上可看到def2-TZVP不考虑counterpoise算的相互作用能误差明显较大,考虑counterpoise改进很显著
使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html


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RgH    时间: 2023-12-22 17:25
sobereva 发表于 2023-12-22 16:42
模型明显不当。参考下文的讨论
18碳环(cyclo[18]carbon)与石墨烯的相互作用:基于簇模型的研究一例
htt ...

谢谢sob老师的答复,我再仔细看看这几篇文章
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RgH    时间: 2023-12-22 17:27
pal 发表于 2023-12-22 14:15
石墨烯太小了吧,O看起来都和饱和边界的H作用了

谢谢,这里取的是4×4大小的,我再优化下模型




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