计算化学公社

标题: MMPBSA中各能量项可以体现哪些作用力 [打印本页]

作者
Author: qjim 时间: 2024-2-29 22:09
标题: MMPBSA中各能量项可以体现哪些作用力
氢键作用的本质是静电相互作用，因此静电能可以体现氢键作用，非极性溶剂化能是体现疏水作用（不知道我理解有没有错）。还有范德华能使范德华力作用的体现吗？还是还包含了其他作用力？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-1 01:43
“氢键作用的本质是静电相互作用” 这仅对一般强度的氢键成立，看下文氢键本质的讨论
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513（http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html）

分清楚能量和力的关系，看下文 “慎用“力”字” 部分
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html）

MMPBSA中的MM作用能部分里面体现了范德华相互作用

作者
Author: qjim 时间: 2024-3-1 11:21

sobereva 发表于 2024-3-1 01:43
“氢键作用的本质是静电相互作用” 这仅对一般强度的氢键成立，看下文氢键本质的讨论
透彻认识氢键本质、 ...

那我可以这么说吗？静电作用（ele）越大氢键作用越大，非溶剂化能（SA）越大疏水作用越大.

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-2 06:29

qjim 发表于 2024-3-1 11:21
那我可以这么说吗？静电作用（ele）越大氢键作用越大，非溶剂化能（SA）越大疏水作用越大.

没前提下显然不成立。两个部分之间静电作用几乎只对应氢键时才能这么说。
SA对应的那叫溶解自由能的非极性部分，是否适合说成疏水作用结合具体体系判断

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)