Seyilaxa 发表于 2024-5-24 20:27
拓扑文件是用什么方法构建的,这种情况一般是成键项参数有点问题
Sunca 发表于 2024-5-24 21:39
先用的charmm-gui生成的pdb文件,拓扑文件是用pdb2gmx命令生成的,但是力场文件里面的残基力场.rtp是我自 ...
Seyilaxa 发表于 2024-5-24 23:38
你没有定义叫C和O的原子,+O和+C自然定位不到连接的原子,看看这篇帖子1L中链接的例子:
http://bbs.kei ...
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