计算化学公社

标题: 高斯优化过渡金属配合物后原分子之间直接断键了，请教一下解决方法 [打印本页]

作者
Author: candicechen 时间: 2024-6-6 19:42
标题: 高斯优化过渡金属配合物后原分子之间直接断键了，请教一下解决方法
各位老师们，我在优化一个过渡金属配合物，使用的泛函是wb97xd，基组是6-31G(d)和lanl2dz，几何优化后的结构与初始结构相差很大，请问这是怎么回事啊？

二编：我算了一下键级，最终确实是B和C从Co上脱离然后这两个之间成键了，请问有什么解决方法吗？

作者
Author: liang666 时间: 2024-6-6 19:51
http://sobereva.com/414

作者
Author: candicechen 时间: 2024-6-6 19:58

liang666 发表于 2024-6-6 19:51
http://sobereva.com/414

谢谢，我看了社长的这篇帖子，正在算键级。再次请教一下，成键是因为我的初始结构不合理吗？

作者
Author: candicechen 时间: 2024-6-6 20:22

liang666 发表于 2024-6-6 19:51
http://sobereva.com/414

老师，我刚刚算了一下键级，确实是如输入文件所示成键了，请问有什么解决方法，可以维持原分子的结构吗

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-6-6 20:30
初始结构是实验结果吗，还是你画的结构？如果实验上没有证据证明初始结构存在，那么初始结构很可能本来就是不合理的

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-7 00:26
wB97XD算这种体系不是好选择，优先建议用PBE0-D3(BJ)，参考
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272（http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html）

lanl2DZ也态过时了，看
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373（http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html）

如果用更像样的计算级别还是配体自发解离，注意检查对外环境的描述、以及自旋多重度的设置等是否合理。并且可以考虑对配位键键长做个柔性扫描看看是否有对应结合状态的极小点

作者
Author: candicechen 时间: 2024-6-11 10:10

sobereva 发表于 2024-6-7 00:26
wB97XD算这种体系不是好选择，优先建议用PBE0-D3(BJ)，参考
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sob ...

谢谢社长的回复，我是先用wb97xd和小基组6-31G(d)和lanl2dz进行优化，再结合SDD和6-311G(d,p)进行单点嫩计算；这种情况下可不可以改变泛函然后依旧使用这两个基组呢？

作者
Author: candicechen 时间: 2024-6-11 11:26

sobereva 发表于 2024-6-7 00:26
wB97XD算这种体系不是好选择，优先建议用PBE0-D3(BJ)，参考
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sob ...

sob大大，再请教一个问题，我再g16上直接在我的输入文件上，将wb97xd改成了PBE0-D3(BJ)，基组改成了def2tzvp，但是一直报错。将PBE0-D3(BJ)改成PBE1PBE/Def2tzvp EmpiricalDispersion=GD3 就可以算，这是我最开始的关键词出错了吗？

作者
Author: zjxitcc 时间: 2024-6-11 11:53

candicechen 发表于 2024-6-11 11:26
sob大大，再请教一个问题，我再g16上直接在我的输入文件上，将wb97xd改成了PBE0-D3(BJ)，基组改成了def2t ...

是的。文章中计算级别书面用语与 Gaussian输入文件关键词不会永远一样。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-12 02:46

candicechen 发表于 2024-6-11 10:10
谢谢社长的回复，我是先用wb97xd和小基组6-31G(d)和lanl2dz进行优化，再结合SDD和6-311G(d,p)进行单点嫩 ...

用wB97XD莫名其妙，对此类问题又不比PBE0强，作为范围分离泛函，其耗时还更高

作者
Author: candicechen 时间: 2024-6-12 11:50

zjxitcc 发表于 2024-6-11 11:53
是的。文章中计算级别书面用语与 Gaussian输入文件关键词不会永远一样。

好的，谢谢老师，我看sob老师推荐使用PBE0-D3(BJ)，请问这个我如果使用的是PBE1PBE/Def2tzvp EmpiricalDispersion=GD3 ，没有用上（BJ），会有什么影响吗

作者
Author: candicechen 时间: 2024-6-12 11:51

sobereva 发表于 2024-6-12 02:46
用wB97XD莫名其妙，对此类问题又不比PBE0强，作为范围分离泛函，其耗时还更高

好的好的，谢谢sob老师！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-12 12:21

candicechen 发表于 2024-6-12 11:50
好的，谢谢老师，我看sob老师推荐使用PBE0-D3(BJ)，请问这个我如果使用的是PBE1PBE/Def2tzvp Empirical ...

影响甚微
记得以后都加上BJ

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