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标题: 利用sobtop一键生成top文件的脚本分享 [打印本页]

作者
Author:
qq286792125    时间: 2024-6-10 16:36
标题: 利用sobtop一键生成top文件的脚本分享
本帖最后由 qq286792125 于 2024-6-10 16:41 编辑

各位老师好,本人编程0基础,用chatgpt写的一键生成top文件的bash脚本供大家参考。
需要在linux系统里安装好Sobtop,Gaussian,
Multiwfn和OpenBabel等软件。
第一步在sobtop目录下,新建RESP和ITP文件夹。

(, 下载次数 Times of downloads: 27)

第二步,在RESP文件夹里,将multiwfn_3.8里的计算电荷的bash文件,RESP_noopt.sh和要产生top文件的化合物放进去,例water.pdb
(, 下载次数 Times of downloads: 18)

第三步,回到sobtop目录,将1.sh拷贝至目录下。
(, 下载次数 Times of downloads: 17)

第四步,运行./1.sh water.pdb,然后会直接在ITP文件夹里生成相应的TOP文件。
(, 下载次数 Times of downloads: 16)
现将1.sh上传到附件,供大家参考。
本贴目的是告诉大家用chatgpt可以写一些简单的程序供自己用。目前编程比较了文心一言,通义千问,kimi和ChatGPT,最后发现只有ChatGPT最好用。




作者
Author:
xptracy    时间: 2024-6-11 14:03
感谢分享
作者
Author:
W@YT    时间: 2025-10-31 14:38
RESP_noopt.sh是什么内容呀
作者
Author:
student0618    时间: 2025-10-31 20:38
W@YT 发表于 2025-10-31 14:38
RESP_noopt.sh是什么内容呀

Multiwfn下载后examples/RESP目录的脚本

详见http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html




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