计算化学公社

标题: 求助：溶解自由能计算问题 [打印本页]

作者
Author: xxtnenu 时间: 2024-6-14 13:34
标题: 求助：溶解自由能计算问题
学生参考327博文计算了阴离子和其失去一个电子的中性结构在水溶剂中的溶质自由能，计算过程使用的方法基组和结果如下表所示，附件中的文件顺序参照327博文计算的四个文件顺序。
请问各位老师，计算2的时候可以使用m062x/ma-tzvp吗？因为在计算过程中使用B2PLYP-D3(BJ)/def2-TZVP会提示空间不足而报错终止任务。还有一个问题是，这两个结构只是相差一个电子，但在计算溶解自由能时差别很大，请问这是正常的结果吗？这也使得最终在水溶剂中的溶质自由能结果差别很大，是否应该在计算中性结构时去掉弥散函数？如果去掉弥散函数二者结果还能相互比较吗？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-6-14 16:41
做双杂化泛函计算内存空间不足，应该改用更适合做双杂化泛函的程序，例如ORCA。不然审稿人要你补双杂化计算，你到时候还是得用ORCA，毕竟ORCA免费，你无法以没买为借口不用。
差一个电子本来就会导致溶解自由能有极大差别，因为溶质电荷改变会显著影响溶质对溶剂的极化作用

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-14 17:17
带净电荷体系的溶解自由能普遍远大于中性体系，经常不在一个数量级，所以差一个电荷会必定造成极大的影响

B2PLYP-D3(BJ)已经比较过时了，更推荐用revDSD-PBEP86-D3(BJ)

较大体系双杂化用Gaussian算着费劲，ORCA利用RI算双杂化不仅快得多（耗时往往只有杂化泛函耗时两倍多），而且对内存/硬盘消耗小得多

顺带一提，离子体系的溶解自由能用uESE会更准一些，见
比SMD算溶解自由能更好的溶剂模型uESE的使用
http://sobereva.com/593（http://bbs.keinsci.com/thread-22879-1-1.html）

作者
Author: xxtnenu 时间: 2024-6-16 14:45

wzkchem5 发表于 2024-6-14 16:41
做双杂化泛函计算内存空间不足，应该改用更适合做双杂化泛函的程序，例如ORCA。不然审稿人要你补双杂化计算 ...

收到，谢谢老师的回复，学生学习使用ORCA的相关内容

作者
Author: xxtnenu 时间: 2024-6-16 14:46

sobereva 发表于 2024-6-14 17:17
带净电荷体系的溶解自由能普遍远大于中性体系，经常不在一个数量级，所以差一个电荷会必定造成极大的影响
...

谢谢老师的回复，学生学习一下uESE模型的相关内容

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