计算化学公社

标题: 大家有xtb批量提交的脚本吗？ [打印本页]

作者
Author: 纪柯南 时间: 2024-10-10 17:31
标题: 大家有xtb批量提交的脚本吗？
各位老师，同学,现在想批量计算2000个分子，想用GFN2-xtb但是有两个问题，如何批量提交呢？xtb计算之后的xyz文件能不能不叫xtbopt.xyz呀？可不可以指定优化出的xyz和molden文件名呢？谢谢大家，麻烦大家了！

作者
Author: 吹梦到西洲 时间: 2024-10-10 17:34
-namespace可以指定输出文件的名称前缀

作者
Author: sobereva 时间: 2024-10-10 17:46
看下文了解shell脚本编写常识
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612（http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html）
使用Gaussian时的几个实用脚本和命令
http://sobereva.com/258（http://bbs.keinsci.com/thread-190-1-1.html）

自己在循环里加个改名命令就完了

作者
Author: 纪柯南 时间: 2024-10-10 19:42

吹梦到西洲发表于 2024-10-10 17:34
-namespace可以指定输出文件的名称前缀

感谢同学，科研顺利！

作者
Author: 纪柯南 时间: 2024-10-10 19:43

sobereva 发表于 2024-10-10 17:46
看下文了解shell脚本编写常识
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612（ ...

谢谢Sob老师，我学会了在帖子里贴出来！

作者
Author: 纪柯南 时间: 2024-10-10 21:29

sobereva 发表于 2024-10-10 17:46
看下文了解shell脚本编写常识
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612（ ...

写出来啦谢谢Sob!
chgname=${inf//.xyz}_opt.xyz
mv xtbopt.xyz $chgname
again_chgname=${inf//.xyz}_molden.input
mv molden.input $again_chgname

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