计算化学公社

标题: 加催化剂的过渡态，L9999报错，催化剂与底物距离很远 [打印本页]

作者
Author: mengwc 时间: 2024-10-25 10:40
标题: 加催化剂的过渡态，L9999报错，催化剂与底物距离很远
我想问一下，加入催化剂的过渡态，L9999报错，输出文件催化剂与底物距离很远。
下面是我的输入文件和输出文件：

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-10-25 11:05
你确认这个过渡态存在吗？

作者
Author: wal 时间: 2024-10-25 12:55
hf/aug-cc-pvtz
这计算级别有点抽象要不你换DFT试试？

作者
Author: wal 时间: 2024-10-25 13:01
(, 下载次数 Times of downloads: 13)
而且你这个起始位置怎么看着这么奇怪，催化剂摆到姥姥家去了，有相关的文章或者依据吗

作者
Author: mengwc 时间: 2024-10-25 17:32

wzkchem5 发表于 2024-10-25 11:05
你确认这个过渡态存在吗？

老师，我是在乙烯和1，3丁二烯反应的过渡态上加了一个F2CS的催化剂，想研究F2CS对乙烯和1，3丁二烯反应的催化作用

作者
Author: mengwc 时间: 2024-10-25 17:39

wal 发表于 2024-10-25 13:01
而且你这个起始位置怎么看着这么奇怪，催化剂摆到姥姥家去了，有相关的文章或者依据吗

你好老师，因为S和乙烯双键能发生弱相互作用，想研究一下这个硫键对乙烯和1，3丁二烯反应的催化作用。
之前有篇文献是卤键对亚胺和1，3丁二烯反应的催化作用，文献中是卤素原子与氮原子发生弱相互作用催化了该反应

作者
Author: mengwc 时间: 2024-10-25 17:41

wal 发表于 2024-10-25 12:55
hf/aug-cc-pvtz
这计算级别有点抽象要不你换DFT试试？

一开始是用的MP2/aug-cc-pVTZ方法太慢了，换的HF想先试一下

作者
Author: wal 时间: 2024-10-25 18:28

mengwc 发表于 2024-10-25 17:41
一开始是用的MP2/aug-cc-pVTZ方法太慢了，换的HF想先试一下

既然把MP2下了，不如改pople系列或者def2系列基组

搭配DFT，算这样的体系应该挺快的
HF/aug-cc-pVTZ这种搭配太奇怪了，像元谋人开飞机
(另外单独一个HF能不能正确描述弱相互作用来着...?)

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-10-25 22:06

mengwc 发表于 2024-10-25 10:32
老师，我是在乙烯和1，3丁二烯反应的过渡态上加了一个F2CS的催化剂，想研究F2CS对乙烯和1，3丁二烯反应的 ...

首先从纯化学角度讲，F2CS很可能自己就会和丁二烯加成，F2CS的反应活性很可能比乙烯强很多
其次，理论级别极其不合理，建议仔细阅读http://sobereva.com/214
最后，你算的是三分子反应，而且两两估计都不能形成稳定的复合物，三分子同时碰撞发生反应的概率极小

作者
Author: sobereva 时间: 2024-10-25 23:56
认真把此文完整读了
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272（http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html）

作者
Author: mengwc 时间: 2024-10-26 09:27

wal 发表于 2024-10-25 18:28
既然把MP2下了，不如改pople系列或者def2系列基组搭配DFT，算这样的体系应该挺快的
HF/aug-cc-pVTZ这 ...

好的谢谢

作者
Author: mengwc 时间: 2024-10-26 11:20

wzkchem5 发表于 2024-10-25 22:06
首先从纯化学角度讲，F2CS很可能自己就会和丁二烯加成，F2CS的反应活性很可能比乙烯强很多
其次，理论级 ...

好的老师，最后这一条，我应该怎么去改我的结构会好一点呢老师，还是说这三个结构本身有问题呢

作者
Author: mengwc 时间: 2024-10-26 11:21

sobereva 发表于 2024-10-25 23:56
认真把此文完整读了
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272（http://bbs.keinsci.com ...

好的谢谢老师，方法基组已改

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-10-26 12:03

mengwc 发表于 2024-10-26 04:20
好的老师，最后这一条，我应该怎么去改我的结构会好一点呢老师，还是说这三个结构本身有问题呢

先确定你要研究的这个问题是不是一个合理的问题。不是如何改结构的问题，而是说你要重新评估你要算的这个反应到底理论上预期能不能发生

作者
Author: mengwc 时间: 2024-10-26 16:46

wzkchem5 发表于 2024-10-26 12:03
先确定你要研究的这个问题是不是一个合理的问题。不是如何改结构的问题，而是说你要重新评估你要算的这个 ...

好的老师，谢谢老师

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