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标题: Gaussian与xtb连用无法产生完整的out文件，freq计算出错求助 [打印本页]

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Author: dahai7719 时间: 2024-11-26 08:33
标题: Gaussian与xtb连用无法产生完整的out文件，freq计算出错求助
用sob老师的421帖子中的方法计算给出例子的过渡态和振动分析，总是不能成功：用的Gaussian 16 C01, xtb 6.7.1, 出现的问题是：
1）能够产生TS.out文件和CHK文件，（见附件）  但是不全，用GV可以打开TS.out看到唯一一个结构。
2）检查gaussian计算的.EOu 文件，里面为空白
3）继续做freq计算出错：找不出具体原因在哪里，（所有的输入文件TS.gjf和freq.gjf为帖子中给出，没有做改动）
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20502 Len=       100 IPos=          4 Q=       267433280
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
Error: segmentation violation
rax 0000000000000000, rbx 0000000005a90010, rcx ffffffffffffffff
rdx 000000000000237c, rsp 00007ffc6dbfdaf8, rbp 00007ffc6dbfdb30
rsi 000000000000000b, rdi 000000000000237c, r8  0000000000000020
r9  0000000000000401, r10 00007ffc6dbfcf20, r11 0000000000000202
r12 00007ffc6dbfde60, r13 00007ffc6dc01e88, r14 000000000ff0b540
r15 00007ffc6dc01e90
  /lib64/libpthread.so.0(+0xf630) [0x2aacfb5c4630]
  /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x2aacfbb09657]
  /sob/g16/l101.exe() [0x4ac3a5]
  /sob/g16/l101.exe() [0x505869]
  /sob/g16/l101.exe() [0x4db6e5]
  /sob/g16/l101.exe() [0x41c487]
  /sob/g16/l101.exe() [0x419327]
  /sob/g16/l101.exe() [0x4138ac]
  /sob/g16/l101.exe() [0x410e9b]
  /sob/g16/l101.exe() [0x410da4]
  /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5) [0x2aacfbaf5555]
  /sob/g16/l101.exe() [0x40b4e9]

作者
Author: sobereva 时间: 2024-11-26 08:56
博文链接要完整贴出来，否则其他人不知道指的什么
将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析
http://sobereva.com/421（http://bbs.keinsci.com/thread-10106-1-1.html）

远程说不清楚，我只能说实测过G16 C.02结合xtb 6.7.1用上文的脚本联用没任何问题。严格确保安装和使用步骤和上文精确一样，并且自行根据中间文件调试脚本

作者
Author: dahai7719 时间: 2024-11-26 13:49

sobereva 发表于 2024-11-26 08:56
博文链接要完整贴出来，否则其他人不知道指的什么
将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、 ...

谢谢sob老师，应该不会是软件版本的原因，我查了Gaussian16 c01 和c02除了后者支持新的GPU外和前者没有本质的区别，我再找找看看能否找到是什么原因，谢谢！

作者
Author: dahai7719 时间: 2024-11-30 08:01
已经解决，查到原因是因为内存不够所致，调大内存后一切正常，如果出现同类问题可以按照此方法排除，再次谢谢sob老师的解惑

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