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标题: 关于机理中间体过渡态的问题 [打印本页]

作者
Author: cccm 时间: 2024-11-29 14:58
标题: 关于机理中间体过渡态的问题
各位老师我在跑中间体过渡态时候遇到了问题图一是反应的机理现在跑完了第一个过渡态图二为IRC的输出文件现在想让C=C键和O=O断开并且链接。但是跑出来的结果是和第一步的过渡态一样。请问各位老师是哪里有问题呀是第一步的过渡态就错了么谢谢各位老师指点。

作者
Author: sai77 时间: 2024-11-29 19:55
什么叫“跑出来的结果是和第一步的过渡态一样”？
IRC关键词怎么写的？或者直接上传IRC输出文件

作者
Author: sobereva 时间: 2024-12-2 04:53
“让C=C键和O=O断开并且链接” 语义不明
跑IRC直接就能证明第一步过渡态找没找对
第二步如果过渡态不知道怎么摆，做断键的柔性扫描帮助确认合适的过渡态初猜
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

作者
Author: cccm 时间: 2024-12-3 10:15

sai77 发表于 2024-11-29 19:55
什么叫“跑出来的结果是和第一步的过渡态一样”？
IRC关键词怎么写的？或者直接上传IRC输出文件

IRC的关键词是这样写的 # IRC=(calcfc,LQA) b3lyp/6-31g(d,p) "D:\V\IRC1.out"

这是按机理猜出的自己物质大概的反应过程，第一步物质与臭氧的过渡态是：两边的O向C=C双键靠近，但是并没有显示键，看了其他帖子知道这是常见问题；第二步初猜想让C=C和O=O断裂，但是跑出来还是两边的O向C=C双键靠近,和第一步一样。
跑过渡态用的关键词：# opt=(calcfc,ts,noeigen) freq b3lyp/6-31g(d,p)

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Author: cccm 时间: 2024-12-3 10:28

sobereva 发表于 2024-12-2 04:53
“让C=C键和O=O断开并且链接” 语义不明
跑IRC直接就能证明第一步过渡态找没找对
第二步如果过渡态不知 ...

不好意思，“让C=C键和O=O断开并且链接”是我表述错误。
按机理的第一步来说臭氧两边的氧已经和C=C链接了，只不过跑出来的过渡态没有显示键。
第二步是想让C=C键和O=O断开。
感谢老师的建议，这就做柔性扫描确认一下。

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